92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1960 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  100 
 
 
1117 aa  2187    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  40.03 
 
 
821 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  53.79 
 
 
660 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  50 
 
 
585 aa  293  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  47.4 
 
 
401 aa  285  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  46.64 
 
 
724 aa  280  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  48.68 
 
 
521 aa  277  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  51.8 
 
 
596 aa  276  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  45.9 
 
 
544 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  46 
 
 
518 aa  267  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  45.7 
 
 
514 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  47.99 
 
 
522 aa  263  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  44.59 
 
 
522 aa  260  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  42.82 
 
 
512 aa  260  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  43.05 
 
 
509 aa  247  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  45.33 
 
 
521 aa  246  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  40.05 
 
 
521 aa  245  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  42.42 
 
 
521 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  38.97 
 
 
599 aa  234  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  41.18 
 
 
522 aa  231  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  41.4 
 
 
569 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  41.69 
 
 
551 aa  226  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  40.73 
 
 
405 aa  219  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  36.19 
 
 
514 aa  215  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  42.16 
 
 
405 aa  203  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  37.5 
 
 
638 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  30.64 
 
 
585 aa  192  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  40.57 
 
 
781 aa  191  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  37.81 
 
 
524 aa  178  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  38.11 
 
 
522 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  39.74 
 
 
802 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  38.61 
 
 
686 aa  166  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  36.08 
 
 
690 aa  165  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  45.79 
 
 
697 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  35.35 
 
 
644 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  35.52 
 
 
402 aa  158  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  33.82 
 
 
470 aa  158  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  44.09 
 
 
478 aa  155  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  39.62 
 
 
542 aa  155  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  32.77 
 
 
394 aa  154  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  42.47 
 
 
649 aa  152  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  30.95 
 
 
740 aa  152  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  35.71 
 
 
734 aa  151  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.2 
 
 
740 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  32.93 
 
 
465 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  40.8 
 
 
700 aa  142  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  43.01 
 
 
479 aa  139  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  30.55 
 
 
509 aa  131  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  30.55 
 
 
509 aa  131  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  30.55 
 
 
509 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  38.59 
 
 
500 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  38.59 
 
 
498 aa  125  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  27.69 
 
 
499 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  27.69 
 
 
499 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  38.42 
 
 
497 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  37.02 
 
 
522 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  33.18 
 
 
517 aa  111  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  35.91 
 
 
517 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  26.28 
 
 
534 aa  73.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  27.1 
 
 
405 aa  73.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  26.86 
 
 
398 aa  70.1  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  27.37 
 
 
389 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  27.87 
 
 
474 aa  65.1  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  26.22 
 
 
386 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  27.41 
 
 
391 aa  62  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  29.28 
 
 
387 aa  62  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  27.27 
 
 
386 aa  61.6  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  24.56 
 
 
388 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  27.49 
 
 
388 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  28.88 
 
 
388 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  27.03 
 
 
392 aa  56.6  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  27.03 
 
 
392 aa  56.6  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  27.03 
 
 
392 aa  56.6  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  26.34 
 
 
400 aa  51.6  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  22.82 
 
 
390 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  22.89 
 
 
389 aa  50.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  22.82 
 
 
390 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  22.48 
 
 
390 aa  50.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  22.47 
 
 
396 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  25.67 
 
 
396 aa  49.3  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  21.83 
 
 
389 aa  49.3  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  21.84 
 
 
396 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  24.56 
 
 
395 aa  48.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  23.66 
 
 
397 aa  48.5  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  23.66 
 
 
397 aa  48.5  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  24.35 
 
 
501 aa  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  24.12 
 
 
389 aa  47.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  22.53 
 
 
390 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  22.53 
 
 
390 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  21.95 
 
 
395 aa  45.8  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  25.68 
 
 
391 aa  45.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  23.37 
 
 
390 aa  44.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>