115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0975 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  100 
 
 		 660 aa  1335    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  60.07 
 
 		 585 aa  363  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  57.19 
 
 		 544 aa  330  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  57.14 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  56.64 
 
 		 522 aa  324  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  51.99 
 
 		 514 aa  323  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  43.36 
 
 		 509 aa  320  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  53.45 
 
 		 521 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  52.46 
 
 		 518 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  53.79 
 
 		 1117 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  51.74 
 
 		 521 aa  303  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  52.11 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  51.39 
 
 		 521 aa  302  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  49.83 
 
 		 724 aa  299  9e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  31.06 
 
 		 638 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  53.85 
 
 		 596 aa  280  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  49.82 
 
 		 821 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  47.37 
 
 		 522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  47.37 
 
 		 522 aa  272  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  39.11 
 
 		 521 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  45.16 
 
 		 405 aa  263  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  46.02 
 
 		 514 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  41.98 
 
 		 551 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  45.62 
 
 		 599 aa  258  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  42.38 
 
 		 569 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  50.18 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  43.25 
 
 		 585 aa  236  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  40.88 
 
 		 524 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  39.01 
 
 		 781 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  41.51 
 
 		 402 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  39.16 
 
 		 690 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  40 
 
 		 522 aa  195  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  44.49 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  36.9 
 
 		 478 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  41.28 
 
 		 542 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  46.6 
 
 		 802 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  34.96 
 
 		 470 aa  183  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  43.5 
 
 		 686 aa  182  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  41.15 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  40.98 
 
 		 700 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  36.16 
 
 		 465 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  43.96 
 
 		 644 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  36.5 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  48.13 
 
 		 697 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  36.52 
 
 		 509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  36.52 
 
 		 509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  35.84 
 
 		 509 aa  165  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  38.1 
 
 		 498 aa  160  9e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  39.02 
 
 		 734 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  43.01 
 
 		 500 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  44.68 
 
 		 517 aa  151  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  45.16 
 
 		 522 aa  150  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  41.71 
 
 		 517 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  43.09 
 
 		 497 aa  146  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  33.44 
 
 		 740 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  33 
 
 		 740 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  31.61 
 
 		 499 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  31.61 
 
 		 499 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  29.53 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  31.4 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  26.38 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  26.41 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  27.75 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  25.25 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  30.85 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  26.77 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  29.44 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  27.72 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  24.48 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  27.53 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  27.53 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  27.53 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  25.64 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  28.19 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  24.14 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  25.19 
 
 		 390 aa  62  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  25.19 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  24.81 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  25.53 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  27.47 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  25.18 
 
 		 396 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  29.65 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  25.7 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  28.98 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  26.86 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  25.37 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  30.34 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  25.37 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  27.01 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  28.57 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  24.88 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  30 
 
 		 478 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1721  hypothetical protein  39.44 
 
 		 188 aa  56.2  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  27.59 
 
 		 389 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  25.12 
 
 		 397 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  25.12 
 
 		 397 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  25.11 
 
 		 397 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  27.13 
 
 		 388 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  26.55 
 
 		 389 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  26.55 
 
 		 389 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>