89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4249 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  100 
 
 		 402 aa  823    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  49.8 
 
 		 514 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  49.21 
 
 		 509 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  47.06 
 
 		 518 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  47.45 
 
 		 521 aa  262  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  48.03 
 
 		 521 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  48.03 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  48.44 
 
 		 522 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  46.85 
 
 		 544 aa  255  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  46.72 
 
 		 522 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  44.14 
 
 		 512 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  37.82 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  45.17 
 
 		 521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  45.17 
 
 		 522 aa  233  3e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  35.07 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  41.51 
 
 		 660 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  37.16 
 
 		 514 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  41.37 
 
 		 585 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  37.5 
 
 		 551 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  43.03 
 
 		 596 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  37.37 
 
 		 569 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  38.15 
 
 		 599 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  33 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  37.74 
 
 		 724 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  35.52 
 
 		 1117 aa  159  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  35.77 
 
 		 821 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  32.27 
 
 		 585 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  35.43 
 
 		 638 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  37.07 
 
 		 524 aa  142  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  37.79 
 
 		 686 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  32.58 
 
 		 690 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  31.02 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  26.12 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  35 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  28.12 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  34.5 
 
 		 734 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  25.71 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  35 
 
 		 781 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  28.2 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  32.56 
 
 		 700 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  31.42 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  31.42 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  36.36 
 
 		 649 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  30.53 
 
 		 509 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  34.3 
 
 		 802 aa  106  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  38.56 
 
 		 697 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  29.55 
 
 		 644 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  27.23 
 
 		 479 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  36.77 
 
 		 500 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  35.54 
 
 		 517 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  38.1 
 
 		 522 aa  96.7  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  36.18 
 
 		 517 aa  96.3  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  37.33 
 
 		 498 aa  92.8  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  24 
 
 		 499 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  24 
 
 		 499 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  37.58 
 
 		 497 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  27.61 
 
 		 740 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  27.61 
 
 		 740 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  26.26 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  24.53 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  26.3 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  34.13 
 
 		 475 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  34.13 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  29.69 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  33.53 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  26.69 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  29.02 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  25.66 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  26.54 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  28.39 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  24.14 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  24.31 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  24.16 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  24.16 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  25 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  25 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  23.85 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  25.17 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  24.7 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  25.17 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  25.23 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  23.15 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  26.98 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  23.9 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  23.74 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2515  hypothetical protein  23.94 
 
 		 518 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  23.45 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  23.45 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  23.45 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>