89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1128 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  100 
 
 		 638 aa  1300    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  53.83 
 
 		 781 aa  432  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  63.84 
 
 		 524 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  31.06 
 
 		 660 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  42.77 
 
 		 644 aa  250  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  44.72 
 
 		 585 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  42.16 
 
 		 522 aa  234  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  40.61 
 
 		 542 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  39.66 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  39.3 
 
 		 596 aa  213  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  41.9 
 
 		 401 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  40.89 
 
 		 522 aa  210  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  38.41 
 
 		 802 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  38.46 
 
 		 521 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  36.1 
 
 		 724 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  36.64 
 
 		 512 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  39.04 
 
 		 544 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  35.41 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  39.72 
 
 		 821 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  36.45 
 
 		 599 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  40.21 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  41.06 
 
 		 522 aa  200  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  37.5 
 
 		 1117 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  32.68 
 
 		 509 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  38.01 
 
 		 690 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  38.75 
 
 		 521 aa  197  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  38.75 
 
 		 521 aa  197  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  36.71 
 
 		 522 aa  196  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  41.8 
 
 		 551 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  36.52 
 
 		 514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  34.94 
 
 		 405 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  41.36 
 
 		 569 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  33.99 
 
 		 470 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  44.72 
 
 		 649 aa  167  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  29.26 
 
 		 500 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  42.79 
 
 		 700 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  43.3 
 
 		 697 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  32.79 
 
 		 478 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  30.33 
 
 		 465 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  43.06 
 
 		 405 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  33.46 
 
 		 585 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  35.43 
 
 		 402 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  39.18 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  40.41 
 
 		 517 aa  140  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  39.38 
 
 		 517 aa  140  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  38.86 
 
 		 522 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  37.63 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  39.27 
 
 		 497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  33.22 
 
 		 740 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  32.19 
 
 		 740 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  27.99 
 
 		 509 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  27.99 
 
 		 509 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  28.42 
 
 		 509 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  31.61 
 
 		 686 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  27.02 
 
 		 499 aa  111  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  27.02 
 
 		 499 aa  111  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  31.84 
 
 		 734 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  28.91 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  27.17 
 
 		 389 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  25.74 
 
 		 386 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  25.84 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  25.72 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  27.31 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  26.56 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  24.76 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  24.46 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  23.79 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  25.65 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  24.82 
 
 		 392 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  24.82 
 
 		 392 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  27.51 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  29 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  24.75 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  24.89 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  24.75 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  27.27 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  24.5 
 
 		 475 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  25.38 
 
 		 388 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  28.19 
 
 		 397 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  28.14 
 
 		 396 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  31.05 
 
 		 534 aa  51.2  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  29.51 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  26.84 
 
 		 390 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  26.52 
 
 		 478 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  26.84 
 
 		 390 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  26.32 
 
 		 390 aa  48.5  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  26.67 
 
 		 389 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09348  conserved hypothetical protein  25.84 
 
 		 672 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.130664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>