81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2564 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  100 
 
 		 781 aa  1567    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  53.83 
 
 		 638 aa  432  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  57.63 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  46.88 
 
 		 644 aa  232  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  42.32 
 
 		 522 aa  232  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  39.31 
 
 		 542 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  37.38 
 
 		 802 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  41.99 
 
 		 596 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  39.01 
 
 		 660 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  42.29 
 
 		 521 aa  197  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  39.22 
 
 		 544 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  39.45 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  31.67 
 
 		 522 aa  195  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  44.19 
 
 		 585 aa  194  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  37.7 
 
 		 724 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  40.57 
 
 		 1117 aa  191  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  42.64 
 
 		 522 aa  191  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  39.13 
 
 		 514 aa  190  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  42.66 
 
 		 690 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  37.14 
 
 		 821 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  37.5 
 
 		 512 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  37.25 
 
 		 522 aa  183  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  36.79 
 
 		 509 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  41.4 
 
 		 551 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  38.49 
 
 		 521 aa  177  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  35.23 
 
 		 401 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  37.88 
 
 		 514 aa  172  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  36.55 
 
 		 521 aa  171  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  35.17 
 
 		 521 aa  171  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  40.09 
 
 		 569 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  40.93 
 
 		 405 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  33.33 
 
 		 599 aa  163  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  44.13 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  35.94 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  41.36 
 
 		 478 aa  152  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  40.49 
 
 		 649 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  40.38 
 
 		 470 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  38.94 
 
 		 700 aa  147  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  38.16 
 
 		 522 aa  144  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  35.47 
 
 		 394 aa  144  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  38.89 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  35.02 
 
 		 585 aa  142  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  37.32 
 
 		 517 aa  141  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  37.44 
 
 		 517 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  39.18 
 
 		 697 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  32.14 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  39.18 
 
 		 479 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  32.53 
 
 		 740 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  32.18 
 
 		 740 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  38.1 
 
 		 497 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  26.07 
 
 		 509 aa  121  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  28.83 
 
 		 509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  28.83 
 
 		 509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  35 
 
 		 402 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  30.57 
 
 		 686 aa  107  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  30.73 
 
 		 499 aa  101  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  30.73 
 
 		 499 aa  101  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  30.08 
 
 		 734 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  27.52 
 
 		 474 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  25.93 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  27.75 
 
 		 405 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  27.69 
 
 		 387 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  27.27 
 
 		 388 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  23.28 
 
 		 386 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  27.31 
 
 		 475 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  27.31 
 
 		 475 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  28.38 
 
 		 388 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  28.65 
 
 		 388 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2515  hypothetical protein  30.16 
 
 		 518 aa  51.2  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  25.41 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  26.78 
 
 		 392 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  26.78 
 
 		 392 aa  50.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  26.78 
 
 		 392 aa  50.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  25.27 
 
 		 386 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  27.35 
 
 		 534 aa  47.8  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  27.19 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  27.19 
 
 		 475 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  26.5 
 
 		 476 aa  45.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  25.54 
 
 		 501 aa  45.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  26.27 
 
 		 475 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  22.92 
 
 		 391 aa  44.3  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>