114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26520 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  72.08 
 
 		 521 aa  802    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  100 
 
 		 522 aa  1052    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  69.67 
 
 		 522 aa  749    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  46.46 
 
 		 509 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  46.9 
 
 		 521 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  45.45 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  44.97 
 
 		 514 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  44.78 
 
 		 518 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  44.66 
 
 		 512 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  42.24 
 
 		 544 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  45.13 
 
 		 521 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  45.71 
 
 		 521 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  41.05 
 
 		 551 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  38.26 
 
 		 569 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  35.98 
 
 		 514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  43.41 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  48.32 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  35.37 
 
 		 524 aa  280  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  47.06 
 
 		 660 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  44.65 
 
 		 596 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  44.59 
 
 		 1117 aa  260  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  46.37 
 
 		 599 aa  259  8e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  42.77 
 
 		 405 aa  257  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  43.86 
 
 		 724 aa  250  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  46.72 
 
 		 402 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  44.33 
 
 		 821 aa  243  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  46.57 
 
 		 405 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  31.09 
 
 		 522 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  30.48 
 
 		 542 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  38.62 
 
 		 585 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  40.89 
 
 		 638 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  29.64 
 
 		 509 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  29.64 
 
 		 509 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  29.91 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  39.48 
 
 		 690 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  42.64 
 
 		 781 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  42.98 
 
 		 649 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  42.06 
 
 		 686 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  32.84 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  45.13 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  38.11 
 
 		 644 aa  167  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  43.92 
 
 		 697 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  39.42 
 
 		 802 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  33.22 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  43.98 
 
 		 700 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  43.01 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  37.22 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  34.75 
 
 		 734 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  42.86 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  40.62 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  43.16 
 
 		 497 aa  139  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  39.15 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  41.49 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  40.21 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.39 
 
 		 740 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.17 
 
 		 740 aa  133  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  26.57 
 
 		 499 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  26.57 
 
 		 499 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  35.36 
 
 		 474 aa  93.2  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  32.83 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  29.41 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  30.93 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  31.05 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  28.29 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  28.63 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  28.57 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  30.21 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  30.35 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  29.95 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  28.66 
 
 		 388 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  30.35 
 
 		 475 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  29.96 
 
 		 475 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  29.95 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  30.39 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  30.39 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  27.69 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  26.95 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  29.46 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  28.78 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  25.3 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  28.77 
 
 		 534 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  27.27 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  30 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  30 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  26.98 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  26.78 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  23.38 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  25.29 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  23.14 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  23.14 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  28.16 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  27.01 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  27.01 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  27.32 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  24.47 
 
 		 390 aa  57  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  28.34 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  24 
 
 		 390 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  26.44 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  24.34 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  24.34 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>