29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2515 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2515  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1028    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  27.24 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  25.48 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  25.24 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  24.95 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  23.34 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  26.61 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  23.34 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  23.87 
 
 		 542 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  30.94 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  28.86 
 
 		 544 aa  67  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  22.69 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  24.55 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  25.3 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  24.81 
 
 		 514 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  23.65 
 
 		 522 aa  52.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  30.16 
 
 		 781 aa  50.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  23.89 
 
 		 551 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  23.79 
 
 		 585 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  29.81 
 
 		 521 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  31.73 
 
 		 521 aa  47.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  29.81 
 
 		 521 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  25.25 
 
 		 660 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  22.91 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  27.5 
 
 		 405 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  25.17 
 
 		 522 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  21.63 
 
 		 802 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  24.73 
 
 		 405 aa  43.5  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  23.94 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>