68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1889 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  98.23 
 
 
509 aa  1034    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1048    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1048    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  35.82 
 
 
514 aa  302  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  34.59 
 
 
521 aa  282  8.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  32.76 
 
 
509 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  33.02 
 
 
514 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  31.1 
 
 
544 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  31.62 
 
 
522 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  31.76 
 
 
518 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  31.07 
 
 
521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  30.7 
 
 
521 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  30.57 
 
 
522 aa  219  6e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  30.51 
 
 
521 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  32.84 
 
 
512 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  31.57 
 
 
522 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  29.64 
 
 
522 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  29.87 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  28.54 
 
 
542 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  28.39 
 
 
524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  27.91 
 
 
569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  35.14 
 
 
401 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  36.52 
 
 
660 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.13 
 
 
740 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  34.51 
 
 
585 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  32.05 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  30.83 
 
 
599 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  30.64 
 
 
740 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  29.38 
 
 
585 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  30.55 
 
 
1117 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  30.2 
 
 
690 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  36.15 
 
 
405 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  27.99 
 
 
638 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  28.02 
 
 
821 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  25.79 
 
 
781 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  28.99 
 
 
644 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  29.48 
 
 
724 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  29.71 
 
 
802 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  31.42 
 
 
402 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  30.2 
 
 
596 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  24.31 
 
 
517 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  23.47 
 
 
517 aa  97.4  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  25.42 
 
 
500 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  33.17 
 
 
686 aa  90.9  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  32.64 
 
 
522 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  25.46 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  28.71 
 
 
649 aa  83.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  23.45 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  28.35 
 
 
697 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  31.35 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  29.73 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  28.88 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  30.21 
 
 
498 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.5 
 
 
700 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  30.81 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2515  hypothetical protein  23.14 
 
 
518 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  24.86 
 
 
734 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  22.1 
 
 
485 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  21.96 
 
 
475 aa  52  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  24.68 
 
 
499 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  24.68 
 
 
499 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  21.96 
 
 
475 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  20.58 
 
 
475 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  20.58 
 
 
475 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  20.37 
 
 
475 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  21.05 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  22.58 
 
 
388 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  21.43 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>