115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1899 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  67.56 
 
 		 521 aa  714    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  66.22 
 
 		 512 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  100 
 
 		 518 aa  1058    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  66.6 
 
 		 514 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  58.98 
 
 		 544 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  59.51 
 
 		 509 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  56.25 
 
 		 522 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  50.95 
 
 		 521 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  50.95 
 
 		 521 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  46.12 
 
 		 522 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  45.82 
 
 		 522 aa  450  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  46.04 
 
 		 521 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  41.39 
 
 		 551 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  40.49 
 
 		 569 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  38.36 
 
 		 514 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  51.16 
 
 		 660 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  52.28 
 
 		 401 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  51.07 
 
 		 585 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  49.38 
 
 		 405 aa  297  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  50.87 
 
 		 724 aa  293  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  51.44 
 
 		 596 aa  280  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  44.74 
 
 		 599 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  46 
 
 		 1117 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  33.57 
 
 		 524 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  47.06 
 
 		 402 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  33.92 
 
 		 542 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  34.12 
 
 		 522 aa  256  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  32.7 
 
 		 509 aa  249  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  32.14 
 
 		 509 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  32.14 
 
 		 509 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  43.58 
 
 		 821 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  47.75 
 
 		 405 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  39.08 
 
 		 585 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  39.66 
 
 		 638 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  39.45 
 
 		 781 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  38.16 
 
 		 690 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  38.13 
 
 		 644 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  39.62 
 
 		 686 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  41.88 
 
 		 802 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  39.22 
 
 		 734 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  48.11 
 
 		 649 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  34.56 
 
 		 470 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  33.73 
 
 		 478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  45.5 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  44.68 
 
 		 700 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  43.46 
 
 		 697 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  32.14 
 
 		 740 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.49 
 
 		 740 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  34.39 
 
 		 394 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  32.36 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  42.41 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  28.98 
 
 		 500 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  42.7 
 
 		 522 aa  134  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  41.85 
 
 		 497 aa  131  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  39.47 
 
 		 517 aa  123  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  38.92 
 
 		 517 aa  123  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  24.31 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  24.31 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  26.15 
 
 		 485 aa  96.7  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  24.21 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  30.46 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2515  hypothetical protein  27.06 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  28.4 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  27.4 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  26.75 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  28.65 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  26.62 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  26.34 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  25.19 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  25.19 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  26.24 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  27.07 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  27.07 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  27.07 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  25.66 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  26.09 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  26.45 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  25.74 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  26.18 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  25.3 
 
 		 397 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  25.12 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  26.44 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  26.6 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  26.52 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  26.52 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  24.89 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  25.12 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  23.72 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  24.88 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  24.71 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  23.7 
 
 		 389 aa  57  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  26.65 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  24.27 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  26.92 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  25.86 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  21.95 
 
 		 389 aa  54.3  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  22.86 
 
 		 390 aa  53.5  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  22.64 
 
 		 390 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  23.7 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  25.29 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>