98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4553 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  99.58 
 
 
475 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  74.42 
 
 
475 aa  734    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  100 
 
 
475 aa  986    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  74.63 
 
 
475 aa  738    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  99.16 
 
 
475 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  51.96 
 
 
485 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  32.11 
 
 
474 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  38.21 
 
 
391 aa  193  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  31.79 
 
 
405 aa  187  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  33.74 
 
 
386 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  33.11 
 
 
390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  32.78 
 
 
390 aa  163  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  32.56 
 
 
390 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  33.89 
 
 
396 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  30.02 
 
 
485 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  34.2 
 
 
386 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  27.54 
 
 
400 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  31.53 
 
 
389 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  33.11 
 
 
391 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  27.43 
 
 
389 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  31.25 
 
 
389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  32.12 
 
 
390 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  32.49 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  31.07 
 
 
395 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  34.11 
 
 
388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  32.39 
 
 
389 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  30.54 
 
 
390 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  35.29 
 
 
392 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  35.09 
 
 
501 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  30.92 
 
 
390 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  31.91 
 
 
390 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  32.59 
 
 
388 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  33.76 
 
 
389 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  34.64 
 
 
392 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  34.64 
 
 
392 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  32.48 
 
 
387 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  32.37 
 
 
390 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  30.87 
 
 
397 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  33.87 
 
 
388 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  28.42 
 
 
398 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  29.52 
 
 
391 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  30.79 
 
 
389 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  30.79 
 
 
389 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  28.34 
 
 
486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  31.79 
 
 
395 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  35.96 
 
 
476 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  31.79 
 
 
396 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  31.13 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  29.71 
 
 
394 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  36.78 
 
 
478 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  31.58 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  36.02 
 
 
478 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  29.51 
 
 
389 aa  133  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  32.9 
 
 
397 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  32.9 
 
 
397 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  29.63 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  29.29 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0923  hypothetical protein  24.38 
 
 
476 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  23.77 
 
 
509 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  32.7 
 
 
599 aa  87.8  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  40.5 
 
 
248 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  27.39 
 
 
514 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  26.92 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  30.35 
 
 
522 aa  79.7  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  23.8 
 
 
512 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  29.84 
 
 
522 aa  76.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  28.29 
 
 
521 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  27.2 
 
 
521 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  24.83 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  23.85 
 
 
521 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  25.68 
 
 
585 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  22.5 
 
 
521 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  26.74 
 
 
544 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  27.07 
 
 
518 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  32.75 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  25.36 
 
 
522 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  25.55 
 
 
405 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  24.11 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  26.73 
 
 
401 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  22.33 
 
 
388 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  24.75 
 
 
638 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  25.37 
 
 
660 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  25.47 
 
 
551 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  27.35 
 
 
514 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  29.78 
 
 
405 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  22.55 
 
 
522 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  25.19 
 
 
724 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  21.03 
 
 
509 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  22.89 
 
 
501 aa  50.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  24.72 
 
 
485 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  20.58 
 
 
509 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  20.58 
 
 
509 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  26.62 
 
 
596 aa  46.6  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  27.19 
 
 
781 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  24.78 
 
 
542 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  27.32 
 
 
821 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  27.91 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  26.62 
 
 
465 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>