81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0674 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  100 
 
 		 697 aa  1415    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  39.51 
 
 		 649 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  72.25 
 
 		 478 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  72.77 
 
 		 700 aa  304  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  71.2 
 
 		 479 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  69.79 
 
 		 465 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  68.23 
 
 		 470 aa  274  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  63.59 
 
 		 394 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  52.66 
 
 		 500 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  51.69 
 
 		 517 aa  225  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  54.17 
 
 		 517 aa  220  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  50.72 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  52.08 
 
 		 497 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  51.58 
 
 		 498 aa  208  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  45.45 
 
 		 585 aa  182  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  46.52 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  46.52 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  48.13 
 
 		 660 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  43.84 
 
 		 522 aa  169  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  43.35 
 
 		 521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  43.98 
 
 		 499 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  43.98 
 
 		 499 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  43.92 
 
 		 522 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  45.79 
 
 		 1117 aa  163  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  43.3 
 
 		 638 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  44.15 
 
 		 551 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  45.5 
 
 		 521 aa  160  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  42.93 
 
 		 724 aa  161  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  43.81 
 
 		 512 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  46.88 
 
 		 401 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  45.03 
 
 		 596 aa  159  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  44.09 
 
 		 405 aa  158  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  44.86 
 
 		 599 aa  158  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  41.45 
 
 		 522 aa  157  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  43.46 
 
 		 518 aa  157  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  42.63 
 
 		 514 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  44.62 
 
 		 544 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  42.71 
 
 		 569 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  43.39 
 
 		 509 aa  153  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  42.13 
 
 		 821 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  43.15 
 
 		 514 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  44.09 
 
 		 405 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  40 
 
 		 524 aa  142  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  39.18 
 
 		 781 aa  141  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  38.58 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  36.65 
 
 		 542 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  38.62 
 
 		 644 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  39.04 
 
 		 585 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  36.27 
 
 		 690 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  38.3 
 
 		 802 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  32.43 
 
 		 734 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  38.56 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  35.29 
 
 		 686 aa  102  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  33.33 
 
 		 740 aa  81.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  28.35 
 
 		 509 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  28.87 
 
 		 509 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  28.35 
 
 		 509 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  30.92 
 
 		 740 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  25.25 
 
 		 405 aa  54.3  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  26.09 
 
 		 501 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  26.09 
 
 		 389 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  28.29 
 
 		 485 aa  52.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1880  hypothetical protein  25.12 
 
 		 535 aa  52  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.177409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  27.42 
 
 		 534 aa  51.6  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  29.41 
 
 		 400 aa  48.9  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  23.2 
 
 		 391 aa  48.9  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  24.72 
 
 		 388 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  27.75 
 
 		 476 aa  47.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  27.08 
 
 		 474 aa  47.8  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  28.1 
 
 		 475 aa  47  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  28.1 
 
 		 475 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  27.04 
 
 		 478 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  29.13 
 
 		 392 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  26.67 
 
 		 478 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  25.28 
 
 		 386 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  29.13 
 
 		 392 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  24.72 
 
 		 387 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  25.74 
 
 		 388 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  26.47 
 
 		 386 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  27.46 
 
 		 485 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  28.16 
 
 		 392 aa  44.3  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>