72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0691 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  100 
 
 		 485 aa  988    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  27.84 
 
 		 501 aa  173  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  29.71 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  26.58 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  26.99 
 
 		 478 aa  143  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  28.87 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  31.78 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  32.49 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  30.51 
 
 		 388 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  31.43 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  29.18 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  29.18 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  31.2 
 
 		 398 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  27.04 
 
 		 387 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  29.6 
 
 		 392 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  28.4 
 
 		 392 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  28.4 
 
 		 392 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  27.78 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  31.35 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  28.51 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  27.34 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  27.44 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  36.05 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  28.19 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  33.57 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  33.57 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  25.51 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  31.11 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  25.38 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  30.88 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  32.84 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  30.88 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  30.41 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  32.84 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  24.48 
 
 		 397 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  24.48 
 
 		 397 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  30.88 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  33.33 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  28.97 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  27.86 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  28.15 
 
 		 390 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  28.15 
 
 		 390 aa  54.3  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  27.01 
 
 		 397 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  28.28 
 
 		 389 aa  53.5  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  29.05 
 
 		 390 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  24.89 
 
 		 521 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  25.09 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  23.31 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  24.46 
 
 		 521 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  28.82 
 
 		 585 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  24.72 
 
 		 475 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  24.72 
 
 		 475 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  25 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  26.9 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  22.83 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  28.83 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  28.99 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  28.99 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  23.47 
 
 		 394 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  28.26 
 
 		 396 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  24.6 
 
 		 475 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  27.54 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  26.14 
 
 		 521 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  26.09 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  24.58 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  27.17 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  27.27 
 
 		 522 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  24.77 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  27.46 
 
 		 697 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  28.37 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  26.85 
 
 		 478 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  27.33 
 
 		 401 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>