88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2848 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  79.02 
 
 
389 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  79.33 
 
 
391 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  90 
 
 
390 aa  717    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  90.51 
 
 
390 aa  722    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  79.27 
 
 
389 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  90.51 
 
 
390 aa  722    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  100 
 
 
390 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  99.74 
 
 
390 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  74.03 
 
 
389 aa  594  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  71.76 
 
 
389 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  72.02 
 
 
389 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  71.69 
 
 
389 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  67.44 
 
 
391 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  66.41 
 
 
389 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  65.04 
 
 
390 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  64.52 
 
 
390 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  67.52 
 
 
395 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  65.73 
 
 
395 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  67.77 
 
 
396 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  68.03 
 
 
396 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  65.91 
 
 
396 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  66.84 
 
 
390 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  65.28 
 
 
391 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  61.48 
 
 
394 aa  488  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  61.08 
 
 
388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  53.55 
 
 
397 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  59.38 
 
 
397 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  59.38 
 
 
397 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  48.05 
 
 
394 aa  361  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  47.79 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  39.14 
 
 
392 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  39.14 
 
 
392 aa  275  9e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  39.14 
 
 
392 aa  275  9e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  42.6 
 
 
391 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  37.81 
 
 
400 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  35.53 
 
 
398 aa  236  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  35.66 
 
 
405 aa  233  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  36.65 
 
 
386 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  36.48 
 
 
388 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  36.39 
 
 
386 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  35.26 
 
 
388 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  33.86 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  34.63 
 
 
388 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  35.94 
 
 
389 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  33.24 
 
 
501 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  32.67 
 
 
475 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  32.67 
 
 
475 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  30.54 
 
 
475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  30.54 
 
 
475 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  30.24 
 
 
475 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  28.53 
 
 
474 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  32.19 
 
 
485 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  28.4 
 
 
476 aa  99.8  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  35.71 
 
 
478 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  27.69 
 
 
478 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  30.15 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  23.21 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  35.46 
 
 
501 aa  72.8  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  23.77 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2065  hypothetical protein  72.5 
 
 
46 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000835722  decreased coverage  0.0000157116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  25.61 
 
 
428 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  22.53 
 
 
388 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  24.69 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  30.88 
 
 
485 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  22.73 
 
 
522 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  25.52 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  24.52 
 
 
521 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  23.11 
 
 
821 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  23.44 
 
 
585 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  24.34 
 
 
522 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  23.3 
 
 
585 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  25.42 
 
 
660 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  24.66 
 
 
512 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  23.85 
 
 
599 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  25.49 
 
 
544 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  24.48 
 
 
509 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  23.53 
 
 
521 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  23.53 
 
 
521 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  23.61 
 
 
514 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  22.68 
 
 
596 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  25.97 
 
 
521 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  29.03 
 
 
248 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  22.17 
 
 
518 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  22.53 
 
 
1117 aa  47  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  27.14 
 
 
724 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  25.47 
 
 
514 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  23.05 
 
 
485 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  23.03 
 
 
405 aa  43.9  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>