44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4914 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  1001    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  49.59 
 
 		 485 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0923  hypothetical protein  34.39 
 
 		 476 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  28.4 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  28.2 
 
 		 475 aa  146  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  28.99 
 
 		 485 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  28.83 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  28.34 
 
 		 475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  28.14 
 
 		 475 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  25.46 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  24.21 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  23.34 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  29.53 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  23.34 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  22.54 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  24.1 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  26.76 
 
 		 474 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  25.73 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  25.73 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  23.51 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  25.15 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  23.65 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  22.88 
 
 		 389 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  25.55 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  22.3 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  25.71 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  28.97 
 
 		 390 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  24.48 
 
 		 396 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  27.01 
 
 		 395 aa  47.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  23.87 
 
 		 388 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  22.54 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  22.55 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  23.36 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  23.25 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  22.58 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  24.29 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  23.36 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  23.78 
 
 		 391 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  22.36 
 
 		 389 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  23.36 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  23.36 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  22.86 
 
 		 390 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  22.11 
 
 		 386 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  21.78 
 
 		 386 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>