69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2675 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  100 
 
 
394 aa  819    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  96.19 
 
 
394 aa  789    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  57.8 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  49.87 
 
 
389 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  49.34 
 
 
389 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  49.1 
 
 
391 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  47.49 
 
 
389 aa  362  6e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  49.21 
 
 
389 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  48.05 
 
 
390 aa  361  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  48.02 
 
 
389 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  47.79 
 
 
390 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  46.97 
 
 
389 aa  359  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  47.53 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  47.01 
 
 
390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  46.75 
 
 
390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  47.76 
 
 
389 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  49.22 
 
 
388 aa  352  7e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  46.48 
 
 
396 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  47.27 
 
 
391 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  46.48 
 
 
395 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  46.48 
 
 
396 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  45.83 
 
 
395 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  47.69 
 
 
391 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  47.52 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  44.42 
 
 
390 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  43.9 
 
 
390 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  47.01 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  47.26 
 
 
397 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  47.26 
 
 
397 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  42.78 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  38.72 
 
 
391 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  35.52 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  35.52 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  35.52 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  32.36 
 
 
398 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  33.42 
 
 
386 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  33.09 
 
 
400 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  32.34 
 
 
405 aa  172  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  33.16 
 
 
386 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  30.55 
 
 
388 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  29.58 
 
 
387 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  31.33 
 
 
388 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  29.58 
 
 
388 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  30.51 
 
 
501 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  31.99 
 
 
389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  31.31 
 
 
475 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  31.31 
 
 
475 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  29.9 
 
 
485 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  29.63 
 
 
475 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  29.63 
 
 
475 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  29.29 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  31.45 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  27.43 
 
 
476 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  27.12 
 
 
478 aa  89.7  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  27.12 
 
 
478 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  42.98 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  26.54 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  29.39 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  23.53 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  38.66 
 
 
501 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  27.27 
 
 
485 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  22.3 
 
 
486 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  26.96 
 
 
521 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  23.47 
 
 
485 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  29.67 
 
 
405 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  22.79 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  26.49 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  24.62 
 
 
509 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  23.41 
 
 
518 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>