71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1945 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  100 
 
 		 394 aa  820    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  96.19 
 
 		 394 aa  789    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  57.69 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  49.6 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  50.4 
 
 		 389 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  49.74 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  48.28 
 
 		 389 aa  359  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  49.87 
 
 		 389 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  47.76 
 
 		 389 aa  358  8e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  47.79 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  48.05 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  47.79 
 
 		 390 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  47.53 
 
 		 390 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  47.23 
 
 		 389 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  47.27 
 
 		 390 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  49.61 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  48.02 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  46.48 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  46.13 
 
 		 395 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  46.21 
 
 		 395 aa  344  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  46.21 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  47.76 
 
 		 391 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  47.18 
 
 		 391 aa  342  8e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  48.04 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  45.19 
 
 		 390 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  44.42 
 
 		 390 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  46.75 
 
 		 390 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  47.52 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  47.52 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  43.31 
 
 		 394 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  37.95 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  35.77 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  35.77 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  35.77 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  31.39 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  33.85 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  31.76 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  32.19 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  33.59 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  29.84 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  30.63 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  31.33 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  29.84 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  31.99 
 
 		 475 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  31.99 
 
 		 475 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  30.4 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  30.66 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  29.97 
 
 		 475 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  29.97 
 
 		 475 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  29.63 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  29.52 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  30.51 
 
 		 474 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  27.12 
 
 		 476 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  26.69 
 
 		 478 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  27.12 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  42.48 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  28.85 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  25.77 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  24.84 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  37.82 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  28.77 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  27.45 
 
 		 521 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  23.65 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  28.83 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  28.36 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  26.02 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  23.41 
 
 		 518 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  24.12 
 
 		 509 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  27.14 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  24.76 
 
 		 544 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  29.79 
 
 		 599 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>