33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2065 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2065  hypothetical protein  100 
 
 
46 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000835722  decreased coverage  0.0000157116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  100 
 
 
389 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  82.93 
 
 
389 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  80.49 
 
 
389 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  80 
 
 
391 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  76.74 
 
 
389 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  78.05 
 
 
395 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  76.74 
 
 
389 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  79.07 
 
 
395 aa  70.5  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  76.74 
 
 
389 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  84.21 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  84.21 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  70 
 
 
390 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  70 
 
 
390 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  72.5 
 
 
390 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  70 
 
 
390 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  72.5 
 
 
390 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  74.36 
 
 
389 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  71.74 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  72.09 
 
 
390 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  67.57 
 
 
391 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  67.57 
 
 
390 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  68.42 
 
 
394 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  65.79 
 
 
388 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  63.16 
 
 
391 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  69.44 
 
 
396 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2247  gp21  51.11 
 
 
49 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0752264  normal  0.0219034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  48.65 
 
 
397 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  58.82 
 
 
391 aa  43.5  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  54.05 
 
 
392 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  54.05 
 
 
392 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  54.05 
 
 
392 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  44.44 
 
 
474 aa  40  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>