123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1362 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1362  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 
381 aa  777    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00341  cobalt-precorrin-6A synthase  96.59 
 
 
381 aa  752    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.136591  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00361  cobalt-precorrin-6A synthase  54.17 
 
 
361 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00441  cobalt-precorrin-6A synthase  50.27 
 
 
386 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  47.04 
 
 
370 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  46.87 
 
 
362 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  44.62 
 
 
372 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0041  cobalt-precorrin-6A synthase  47.67 
 
 
362 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0036  cobalt-precorrin-6A synthase  45.11 
 
 
362 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270806  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0045  cobalt-precorrin-6A synthase  45.43 
 
 
368 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2363  cobalt-precorrin-6A synthase  38.06 
 
 
384 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  40.38 
 
 
385 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1053  cobalt-precorrin-6A synthase  39.34 
 
 
370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301385  hitchhiker  0.000449274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2413  cobalt-precorrin-6A synthase  38.06 
 
 
384 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0295  cobalt-precorrin-6A synthase  39.1 
 
 
379 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0309656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0905  cobalt-precorrin-6A synthase  39.82 
 
 
385 aa  226  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.762763  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0190  cobalt-precorrin-6A synthase  40.18 
 
 
374 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1557  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.25 
 
 
371 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  28.61 
 
 
373 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.76 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  31.93 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.52 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  32.03 
 
 
366 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.97 
 
 
576 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.71 
 
 
365 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  27.53 
 
 
365 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  27.3 
 
 
365 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  28.46 
 
 
352 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  30.77 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  28.48 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.47 
 
 
382 aa  93.2  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  26.67 
 
 
370 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  29.51 
 
 
378 aa  86.3  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  22.88 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.51 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.25 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.08 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  29.33 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  29.06 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  26.59 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  29.54 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  25.56 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  25.56 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  25.56 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.79 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  25.56 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  25.28 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  25.24 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  23.41 
 
 
383 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  26.87 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  25.62 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.69 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.61 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  25.27 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.21 
 
 
361 aa  67  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  22.61 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  24.7 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  26.15 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  22.73 
 
 
349 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  22.49 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  23.75 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  25.33 
 
 
362 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.45 
 
 
350 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  24.13 
 
 
363 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  27.52 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  25.77 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  26.38 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  25.83 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  24.42 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  24.42 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  27.35 
 
 
369 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  25.9 
 
 
319 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  24.42 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  24.42 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  24.57 
 
 
363 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.51 
 
 
403 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  26.88 
 
 
362 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  27.05 
 
 
336 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  27.65 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  21.64 
 
 
437 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  25.6 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.2 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  25.3 
 
 
362 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  25.3 
 
 
362 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  22.91 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  25.3 
 
 
362 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  25.27 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  24.56 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  22.14 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  23.71 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.48 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  25 
 
 
376 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  26.07 
 
 
371 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  27.31 
 
 
353 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  24.35 
 
 
365 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  27.98 
 
 
357 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  24.36 
 
 
373 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.46 
 
 
353 aa  53.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.61 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.91 
 
 
362 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>