135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2363 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2363  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 
384 aa  781    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2413  cobalt-precorrin-6A synthase  94.79 
 
 
384 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  62.37 
 
 
385 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1053  cobalt-precorrin-6A synthase  60.43 
 
 
370 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301385  hitchhiker  0.000449274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1557  cobalamin biosynthesis protein CbiD  61.89 
 
 
371 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0905  cobalt-precorrin-6A synthase  60.33 
 
 
385 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.762763  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0295  cobalt-precorrin-6A synthase  56.27 
 
 
379 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0309656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0190  cobalt-precorrin-6A synthase  47.75 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00361  cobalt-precorrin-6A synthase  40.58 
 
 
361 aa  252  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00341  cobalt-precorrin-6A synthase  38.74 
 
 
381 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.136591  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1362  cobalt-precorrin-6A synthase  39.27 
 
 
381 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00441  cobalt-precorrin-6A synthase  38.48 
 
 
386 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0045  cobalt-precorrin-6A synthase  40.45 
 
 
368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0041  cobalt-precorrin-6A synthase  40.5 
 
 
362 aa  229  5e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  35.97 
 
 
372 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  37.67 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  41.34 
 
 
362 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0036  cobalt-precorrin-6A synthase  40.3 
 
 
362 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.5 
 
 
390 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  32.52 
 
 
381 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  30.68 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  31.73 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32 
 
 
382 aa  137  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  31.49 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  27.27 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.8 
 
 
385 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  27.57 
 
 
370 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  32.8 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  28.41 
 
 
365 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.2 
 
 
365 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  28.12 
 
 
365 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  32.46 
 
 
369 aa  127  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  29.64 
 
 
378 aa  126  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  31.16 
 
 
366 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.43 
 
 
384 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  30.6 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  30.6 
 
 
379 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  30.6 
 
 
379 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  30.6 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  32.71 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  30.6 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.22 
 
 
576 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.25 
 
 
349 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  33.44 
 
 
366 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.89 
 
 
359 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  24.2 
 
 
383 aa  92.8  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  26.27 
 
 
341 aa  92  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  26.54 
 
 
363 aa  90.1  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.31 
 
 
481 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.94 
 
 
358 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  26.71 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  27.84 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  29.68 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  29.02 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.55 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  26.56 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  27.8 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  26.56 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  26.56 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  26.56 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.88 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.69 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  26.88 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  27.73 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  26.25 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  27.16 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  25.16 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  29.9 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  26.82 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  29.79 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.69 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  26.59 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  27.44 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  28.47 
 
 
364 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  23.31 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  28.47 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  25 
 
 
602 aa  74.7  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  26.25 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  27.9 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  25.1 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  27.48 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  27.84 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.1 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  28.32 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.08 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  27.42 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  27.42 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  27.8 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  27.27 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.43 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  27.59 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  27.59 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.43 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  26.83 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  25.97 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.86 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  25 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  24.41 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.74 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>