117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00351 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 
372 aa  745    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  70 
 
 
370 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  68.78 
 
 
362 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0036  cobalt-precorrin-6A synthase  69.34 
 
 
362 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270806  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00361  cobalt-precorrin-6A synthase  49.43 
 
 
361 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00441  cobalt-precorrin-6A synthase  42.43 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1362  cobalt-precorrin-6A synthase  44.62 
 
 
381 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00341  cobalt-precorrin-6A synthase  44.35 
 
 
381 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.136591  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0041  cobalt-precorrin-6A synthase  40.56 
 
 
362 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0045  cobalt-precorrin-6A synthase  43.14 
 
 
368 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2363  cobalt-precorrin-6A synthase  35.97 
 
 
384 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2413  cobalt-precorrin-6A synthase  36.24 
 
 
384 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0905  cobalt-precorrin-6A synthase  34.76 
 
 
385 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.762763  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1053  cobalt-precorrin-6A synthase  33.97 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301385  hitchhiker  0.000449274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  32.37 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0295  cobalt-precorrin-6A synthase  34.66 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0309656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0190  cobalt-precorrin-6A synthase  33.87 
 
 
374 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1557  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.74 
 
 
371 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  29.09 
 
 
365 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  30.58 
 
 
381 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.52 
 
 
390 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  31.41 
 
 
365 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.73 
 
 
385 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  26.56 
 
 
373 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.7 
 
 
576 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  32.69 
 
 
369 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.06 
 
 
365 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  29 
 
 
352 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.87 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  25.25 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  26.17 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  24.92 
 
 
365 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  27.72 
 
 
363 aa  92.8  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  26.64 
 
 
370 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  30.5 
 
 
378 aa  89.7  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  27.36 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  28.28 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  31.41 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.48 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  30.11 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  26.13 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  26.48 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  26.13 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  26.13 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  25.78 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.65 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.48 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.79 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  27.86 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.65 
 
 
481 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.78 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.18 
 
 
403 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  26.1 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  22.16 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  22.56 
 
 
383 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  22.56 
 
 
388 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  21.55 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.46 
 
 
353 aa  63.2  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.24 
 
 
356 aa  62.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.81 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.71 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.32 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  23.38 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  21.82 
 
 
437 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  22.3 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  21.31 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  21.53 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  24.07 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  24.07 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.46 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.27 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  22.45 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  24.25 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.22 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  22.74 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  23.08 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  22.74 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  22.74 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  26.7 
 
 
449 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.793158 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  22.74 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  22.74 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  22.78 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  23.26 
 
 
363 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  22.14 
 
 
392 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  20.82 
 
 
370 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  24.47 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  22.33 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  24.78 
 
 
602 aa  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  22.56 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.25 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  21.28 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  22.4 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  23.12 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  23.2 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  21.82 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  25.99 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  21.07 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  24.91 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  23.65 
 
 
365 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105122 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>