142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0441 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 		 367 aa  727    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 		 367 aa  727    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  78.8 
 
 		 375 aa  535  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  76.03 
 
 		 365 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  73.87 
 
 		 373 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  73.22 
 
 		 365 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  67.57 
 
 		 381 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  64.38 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  62.53 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  58.65 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  45.95 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  49.47 
 
 		 403 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  45.26 
 
 		 413 aa  258  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  47.37 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  49 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  52.22 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.45 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  46.61 
 
 		 411 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  46.58 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  45.57 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  43.57 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  41.19 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  42.38 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  42.72 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  42.72 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  42.38 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  37.88 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  44.67 
 
 		 357 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.1 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  40.16 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.87 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  39.55 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  39.55 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2522  cobalt-precorrin-6A synthase  51.11 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0994742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  40.55 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  39.55 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  37.33 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  39.55 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  39.55 
 
 		 364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  39.55 
 
 		 364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  42.52 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.54 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  38.55 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  39.28 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  39.55 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  39.55 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.11 
 
 		 370 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  39 
 
 		 363 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  39.61 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  42.98 
 
 		 376 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1716  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.92 
 
 		 362 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.3857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.71 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  37.09 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  44.16 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  41.97 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  42.61 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1978  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  40.89 
 
 		 489 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.51 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  37.88 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  38.36 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  43.25 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  39.26 
 
 		 602 aa  180  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.09 
 
 		 369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  40.83 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  39.45 
 
 		 319 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  36.61 
 
 		 366 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.85 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  39.46 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.07 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  38.49 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  39.94 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  40.87 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  38.54 
 
 		 352 aa  176  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.35 
 
 		 363 aa  176  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  44.67 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  41.67 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.14 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  40.99 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  40.81 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  40.17 
 
 		 373 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  37.93 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.98 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  39 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  40 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.93 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39 
 
 		 361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  37.5 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  46.09 
 
 		 449 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.793158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.99 
 
 		 384 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.24 
 
 		 576 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  40.89 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  40.58 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.04 
 
 		 385 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.5 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  34.16 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  35.69 
 
 		 365 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  32.2 
 
 		 365 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  33.42 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  35.46 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  30.62 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>