143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1374 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  100 
 
 		 385 aa  778    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  50.85 
 
 		 384 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  48.64 
 
 		 481 aa  310  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  43.8 
 
 		 366 aa  259  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  44.84 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  43.13 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  42.7 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.19 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  39.1 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  46.1 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  42.74 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  40.98 
 
 		 373 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  38.68 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  38.68 
 
 		 379 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  38.68 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  38.68 
 
 		 379 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  38.68 
 
 		 379 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  41.24 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  38.57 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  38.83 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.09 
 
 		 576 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.98 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  39.33 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  37.46 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  37.46 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  37.46 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  37.46 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  34.46 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  37.13 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  37.05 
 
 		 363 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  36.86 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  36.22 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  35.83 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.42 
 
 		 382 aa  193  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  36.86 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.39 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  36.83 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.86 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  36.42 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  36.42 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  33.99 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  36.98 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  36.22 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.76 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  36.54 
 
 		 363 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.92 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  37.46 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.78 
 
 		 356 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  37.41 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.26 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.08 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  34.55 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  35.87 
 
 		 366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  35.76 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  37.47 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  36.01 
 
 		 364 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  36.89 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.08 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  37.11 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  39.15 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  36.46 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  37.38 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  38.95 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  36.26 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  38.38 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  36.07 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.29 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.47 
 
 		 403 aa  166  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  38.8 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.72 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  36.26 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  32.03 
 
 		 351 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.21 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  33.15 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  35.24 
 
 		 368 aa  156  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.29 
 
 		 350 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.58 
 
 		 360 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  33.73 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  39.69 
 
 		 602 aa  152  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  34.91 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  32.31 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  32.66 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  37.72 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.96 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.6 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  32.68 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  32.97 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  29.95 
 
 		 385 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  36.08 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  36.08 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  34.74 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  30.56 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  34.03 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  39.3 
 
 		 411 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  33.05 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  32.62 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  37.2 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  33.12 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>