143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3651 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  100 
 
 		 358 aa  718    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  51.15 
 
 		 350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  44.16 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  43.43 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  43.26 
 
 		 362 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  45.85 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  43.17 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  43.53 
 
 		 362 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  43.26 
 
 		 363 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.96 
 
 		 369 aa  195  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  42.55 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  42.55 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  43.22 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  44.07 
 
 		 366 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  42.45 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  41.73 
 
 		 370 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  43.84 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  45.82 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  43.48 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.61 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  45.59 
 
 		 365 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  38.33 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  41.97 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  42.7 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  44.03 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.78 
 
 		 385 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.35 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  41.61 
 
 		 364 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  40.64 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  42.34 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  41.97 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  41.61 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  42.7 
 
 		 357 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  46.05 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.67 
 
 		 384 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.61 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  38 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  41.16 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  41.16 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  41.16 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  41.16 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  41.16 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  33.88 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  40.19 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.7 
 
 		 481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.48 
 
 		 353 aa  173  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  41.33 
 
 		 368 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  37.5 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  33.99 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  38.13 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.27 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  45.27 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  43.07 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.79 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  42.25 
 
 		 421 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  35.03 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  38.32 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  37.73 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  43.11 
 
 		 364 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.86 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.92 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.08 
 
 		 390 aa  165  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  36.24 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.07 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.96 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  41.72 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.43 
 
 		 361 aa  163  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  44.04 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.41 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.89 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  40.43 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  38.33 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  36.93 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  36.93 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  37.38 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  35.31 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  35.31 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  35.31 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  35.03 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  43.98 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.49 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  37.79 
 
 		 413 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  40.65 
 
 		 381 aa  155  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  35.03 
 
 		 379 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.76 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  35.75 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  42.65 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  42.44 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  42.07 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  34.7 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  41.57 
 
 		 602 aa  150  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.51 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.26 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  35.52 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  35.8 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  38.72 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  34.93 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  35.73 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  40.15 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.11 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>