138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1196 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  97.51 
 
 		 362 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 		 362 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  95.3 
 
 		 363 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 		 362 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  93.09 
 
 		 362 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  98.34 
 
 		 362 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  95.58 
 
 		 362 aa  695    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  83.7 
 
 		 363 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  83.89 
 
 		 364 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  83.7 
 
 		 364 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  83.7 
 
 		 364 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  83.89 
 
 		 363 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  83.43 
 
 		 363 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  79.84 
 
 		 372 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  81.97 
 
 		 366 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  81.99 
 
 		 366 aa  577  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  81.16 
 
 		 366 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  80.27 
 
 		 365 aa  567  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  76.18 
 
 		 365 aa  558  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  77.01 
 
 		 370 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  76.45 
 
 		 370 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  73.96 
 
 		 364 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  73.41 
 
 		 364 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  73.41 
 
 		 364 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  83.23 
 
 		 319 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  73.41 
 
 		 364 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  60.32 
 
 		 384 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  59.28 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  58.36 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  52.07 
 
 		 364 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  51.5 
 
 		 368 aa  315  8e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  53.98 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  52.63 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  53.97 
 
 		 421 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  53.28 
 
 		 376 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  53.24 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  49.43 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  52.92 
 
 		 349 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  50 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  51.09 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  48.44 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  50.42 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  50.82 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  50.44 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  48.31 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  45.36 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  44.26 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  42.61 
 
 		 371 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.26 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  46.31 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.83 
 
 		 361 aa  225  8e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  43.52 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.23 
 
 		 362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  43.27 
 
 		 413 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.64 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  44.48 
 
 		 411 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  42.56 
 
 		 369 aa  208  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  40.56 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.42 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.4 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.55 
 
 		 356 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  42.99 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.85 
 
 		 369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  38.1 
 
 		 366 aa  195  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.1 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  42.12 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  42.9 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.55 
 
 		 358 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.21 
 
 		 384 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.71 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.42 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2522  cobalt-precorrin-6A synthase  44.57 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0994742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  40.29 
 
 		 369 aa  189  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  39.72 
 
 		 365 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  39.04 
 
 		 393 aa  189  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.79 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  38.27 
 
 		 365 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  45.11 
 
 		 576 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1716  cobalamin biosynthesis protein CbiD  44.98 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.3857  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  42.86 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  42.86 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  45.8 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  37.9 
 
 		 373 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  37.66 
 
 		 602 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  39.43 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  41.59 
 
 		 375 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.5 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  39.46 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.27 
 
 		 481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  36.23 
 
 		 392 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  39.12 
 
 		 373 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  33.96 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.74 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  32.68 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  39.12 
 
 		 370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  46.88 
 
 		 449 aa  165  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.793158 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  31.65 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  35.13 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  38.95 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  35.26 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>