122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00441 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_00441  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 
386 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00361  cobalt-precorrin-6A synthase  60.06 
 
 
361 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1362  cobalt-precorrin-6A synthase  50.27 
 
 
381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00341  cobalt-precorrin-6A synthase  50.27 
 
 
381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.136591  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0041  cobalt-precorrin-6A synthase  61.83 
 
 
362 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0045  cobalt-precorrin-6A synthase  59.41 
 
 
368 aa  358  8e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  42.12 
 
 
362 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  42.43 
 
 
372 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  41.13 
 
 
370 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0036  cobalt-precorrin-6A synthase  43.17 
 
 
362 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270806  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2363  cobalt-precorrin-6A synthase  37.89 
 
 
384 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0295  cobalt-precorrin-6A synthase  39.94 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0309656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0905  cobalt-precorrin-6A synthase  41.27 
 
 
385 aa  239  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.762763  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1053  cobalt-precorrin-6A synthase  38.9 
 
 
370 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301385  hitchhiker  0.000449274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2413  cobalt-precorrin-6A synthase  36.7 
 
 
384 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  37.47 
 
 
385 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0190  cobalt-precorrin-6A synthase  41.8 
 
 
374 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1557  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.63 
 
 
371 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  27.8 
 
 
365 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  27.16 
 
 
365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  24.3 
 
 
352 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.04 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  30.29 
 
 
373 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.17 
 
 
365 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  30.15 
 
 
379 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  29.76 
 
 
365 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  29.78 
 
 
379 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  29.78 
 
 
379 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  29.78 
 
 
379 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  29.78 
 
 
379 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  28.79 
 
 
366 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.05 
 
 
390 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  28.26 
 
 
381 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  26.95 
 
 
363 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.3 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  25.93 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.93 
 
 
576 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  27.56 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.16 
 
 
369 aa  89.7  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.42 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  25.09 
 
 
365 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  25.36 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.58 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.92 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  25.48 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  23.02 
 
 
378 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.71 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  25.29 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.81 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  31.25 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  20.5 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  25.4 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.35 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  25.77 
 
 
437 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  25 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  25.41 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.86 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  26.29 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.34 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.03 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.89 
 
 
350 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  27.11 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  24.67 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.83 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  27.16 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  27.68 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  26.61 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.11 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.44 
 
 
356 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  24.89 
 
 
375 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  24.36 
 
 
602 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  26.74 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  27.21 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  28.87 
 
 
366 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  26.9 
 
 
381 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  26.74 
 
 
364 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  26.74 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  26.74 
 
 
364 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  26.74 
 
 
364 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.72 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1978  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  29.28 
 
 
489 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  27.73 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  24.53 
 
 
365 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  27.73 
 
 
362 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  26.71 
 
 
362 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  27.8 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  27.8 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  29.03 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  26.42 
 
 
364 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  26.75 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  26.67 
 
 
367 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  26.67 
 
 
367 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  27.8 
 
 
362 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  22.75 
 
 
356 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  27.4 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.92 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.94 
 
 
370 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  24.12 
 
 
371 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  27.18 
 
 
364 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  25.52 
 
 
364 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>