143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0698 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 		 352 aa  705    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  51.13 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  49.55 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  48.96 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  46.33 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  41.71 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.74 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  39.6 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  43.87 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.4 
 
 		 576 aa  229  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.94 
 
 		 384 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.95 
 
 		 390 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  39.94 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  39.66 
 
 		 365 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  39.66 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  39.66 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  39.66 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  39.66 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  44.21 
 
 		 369 aa  215  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  37.98 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  42.86 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.61 
 
 		 481 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.55 
 
 		 369 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  39.29 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  40.35 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.05 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  38.74 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  31.18 
 
 		 364 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  31.18 
 
 		 364 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  31.18 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  31.18 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  31.18 
 
 		 363 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.5 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  41.6 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.56 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  30.38 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  37.83 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.62 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.53 
 
 		 369 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  37.74 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.35 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  32.29 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  29.18 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.46 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  33.61 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.15 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  33.22 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.49 
 
 		 362 aa  169  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  32.79 
 
 		 362 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  30.86 
 
 		 365 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.99 
 
 		 361 aa  169  9e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  32.1 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  38.54 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  38.54 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  32.75 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  36.03 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  30.79 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  30.84 
 
 		 372 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  30.09 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  32.68 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  32.68 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  33.14 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  29.71 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  32.68 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  33.33 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  33 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  30.52 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.73 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  33.14 
 
 		 413 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  31.66 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  32.18 
 
 		 371 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  32.32 
 
 		 381 aa  159  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  29.37 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  35.53 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.33 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  31.8 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.82 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  36.01 
 
 		 381 aa  155  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  32.38 
 
 		 602 aa  155  8e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  33.14 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  35.01 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  37.27 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  33.76 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  31.2 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  34.65 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  31.67 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  32.12 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  32.84 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  35.82 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.44 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  26.49 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  33.05 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  33.55 
 
 		 357 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  32.18 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.84 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  33.88 
 
 		 376 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  31.41 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.66 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.43 
 
 		 371 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  31.91 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>