141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2627 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 		 353 aa  705    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  66.86 
 
 		 368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  66.57 
 
 		 368 aa  411  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  66 
 
 		 368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  61.65 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  60.86 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  59.38 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  60.06 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  58.45 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  59.09 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  59.89 
 
 		 421 aa  371  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  59.48 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  56.73 
 
 		 376 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  61.52 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  55.43 
 
 		 361 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  51.27 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  51.14 
 
 		 363 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  53.76 
 
 		 373 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  51.27 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  51.27 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  51.14 
 
 		 364 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  51.14 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  51.45 
 
 		 362 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  50.58 
 
 		 362 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  50.28 
 
 		 363 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  50 
 
 		 366 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  49.43 
 
 		 362 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  49.43 
 
 		 362 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  50.43 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  49.72 
 
 		 364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  47.28 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  48.71 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  49.71 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  48.58 
 
 		 362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  49.72 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  49.29 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  47.56 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  48.16 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  49.43 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  47.51 
 
 		 372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  51.26 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  47.04 
 
 		 365 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  49.72 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  43.84 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  45.16 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  39.39 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  39.33 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.02 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.15 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  42.9 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  38.21 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  43.87 
 
 		 365 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.93 
 
 		 361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.08 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.62 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.89 
 
 		 356 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  37.93 
 
 		 602 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.26 
 
 		 356 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  38.61 
 
 		 381 aa  195  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  38.51 
 
 		 369 aa  195  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  40.52 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.9 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.58 
 
 		 392 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  37.57 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  40.53 
 
 		 365 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  37.95 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  37.95 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  39.22 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.66 
 
 		 576 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.82 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  40.07 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  38.04 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  36.59 
 
 		 383 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  45.56 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  43.01 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  43.01 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.33 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  40.83 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  36.49 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  39.87 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  32.76 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  36.31 
 
 		 373 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.7 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.65 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.11 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.61 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  33.7 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.69 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.01 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1716  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.02 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.3857  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  32.49 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  42.75 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  37.7 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  37.74 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  36.26 
 
 		 365 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  35.9 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2522  cobalt-precorrin-6A synthase  41.76 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0994742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.58 
 
 		 382 aa  145  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  31.46 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  31.93 
 
 		 365 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>