140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2454 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 
364 aa  693    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  87.09 
 
 
364 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  67.13 
 
 
376 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  65.63 
 
 
367 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  66.95 
 
 
376 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  63.9 
 
 
361 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  63.94 
 
 
357 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  60.06 
 
 
353 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  62.04 
 
 
363 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  61.24 
 
 
373 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  57.3 
 
 
368 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  58.04 
 
 
421 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  59.04 
 
 
357 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  57.82 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  57.54 
 
 
368 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  53.19 
 
 
362 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  53.19 
 
 
363 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  52.63 
 
 
362 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  52.63 
 
 
362 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  52.08 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  52.62 
 
 
363 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  52.62 
 
 
364 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  52.62 
 
 
364 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  58.31 
 
 
349 aa  325  7e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  52.08 
 
 
362 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  52.34 
 
 
363 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  52.34 
 
 
364 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  51.52 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  52.08 
 
 
363 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  49.19 
 
 
372 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  50.27 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  50.27 
 
 
366 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  49.29 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  48.44 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  48.73 
 
 
370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  49.86 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  49.86 
 
 
364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  49.16 
 
 
364 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  49.31 
 
 
366 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  47.67 
 
 
366 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  49.29 
 
 
364 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  52.81 
 
 
319 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  43.84 
 
 
384 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  49.58 
 
 
369 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  45.4 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  43.65 
 
 
365 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  47.01 
 
 
362 aa  209  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  44.51 
 
 
388 aa  203  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.51 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  41.37 
 
 
392 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.78 
 
 
576 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  43.27 
 
 
369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  45.93 
 
 
403 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.97 
 
 
356 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.86 
 
 
356 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.64 
 
 
360 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  44.89 
 
 
369 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  38.93 
 
 
413 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  39.08 
 
 
413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  48.55 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  41.46 
 
 
393 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  43.38 
 
 
369 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  45.36 
 
 
381 aa  186  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  40.27 
 
 
411 aa  185  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  47.64 
 
 
353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  44.27 
 
 
388 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.81 
 
 
369 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  33.14 
 
 
352 aa  180  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  46.48 
 
 
350 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  40.99 
 
 
383 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  40.43 
 
 
365 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1716  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.69 
 
 
362 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.3857  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  38.15 
 
 
381 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.97 
 
 
410 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  45.08 
 
 
365 aa  175  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  44.67 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  44.67 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  36.05 
 
 
602 aa  173  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  40.75 
 
 
373 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  39.14 
 
 
365 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.25 
 
 
358 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  37.5 
 
 
381 aa  169  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  35 
 
 
371 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  40.51 
 
 
375 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  36.93 
 
 
366 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.27 
 
 
384 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  36.34 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.69 
 
 
365 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.91 
 
 
382 aa  162  9e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  32.01 
 
 
365 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  34.76 
 
 
437 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.45 
 
 
371 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2522  cobalt-precorrin-6A synthase  44.83 
 
 
380 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0994742  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  31.36 
 
 
369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.06 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  32.19 
 
 
365 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1978  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  36.99 
 
 
489 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  42.26 
 
 
370 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.45 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.53 
 
 
390 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>