143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1290 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 		 373 aa  753    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  52.75 
 
 		 365 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  52.59 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  53.28 
 
 		 576 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  48.18 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  41.87 
 
 		 365 aa  272  7e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  44.64 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  45.14 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  41 
 
 		 365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.98 
 
 		 385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  41.3 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.21 
 
 		 384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.86 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  39.44 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.29 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  40.33 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  40.33 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  40.33 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  40.33 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  39.94 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.9 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  40.33 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  39.94 
 
 		 365 aa  222  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  44.23 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  37.93 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  39.07 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.24 
 
 		 361 aa  203  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.2 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  39.56 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  39.27 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  38.53 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  38.53 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  38.53 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  38.53 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  41.99 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  42.95 
 
 		 364 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  40.46 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  42.62 
 
 		 364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  38.28 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  40.06 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  41.35 
 
 		 364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.97 
 
 		 481 aa  196  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  38.53 
 
 		 363 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.46 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.66 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  42.54 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  40.32 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.95 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  40.86 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  40.32 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.38 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  40.48 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.66 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  41.69 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  41.37 
 
 		 365 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  36.62 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  40.34 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  36.03 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  38.63 
 
 		 413 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  40.51 
 
 		 363 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  42.38 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  39.12 
 
 		 362 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  39.12 
 
 		 362 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  39.29 
 
 		 381 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  39.12 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  39.12 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  39.24 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  41.79 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  46.05 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  37.74 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.33 
 
 		 353 aa  176  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  38.78 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  39.12 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  37.88 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  39.89 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  37.92 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.49 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  39.18 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  39 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  39 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  37.62 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  39.62 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  37.23 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  36.34 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  38.73 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  40.95 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  35.65 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.29 
 
 		 369 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  40.18 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  36.77 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  37.98 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  31.82 
 
 		 437 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.44 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.45 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1053  cobalt-precorrin-6A synthase  32.18 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301385  hitchhiker  0.000449274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1978  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  36.33 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  38.31 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  36.88 
 
 		 602 aa  156  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>