137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0804 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  100 
 
 		 410 aa  832    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  47.06 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1978  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  47.19 
 
 		 489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  43.76 
 
 		 449 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.793158 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1716  cobalamin biosynthesis protein CbiD  45.61 
 
 		 362 aa  242  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.3857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.68 
 
 		 437 aa  239  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  39.37 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  39.13 
 
 		 413 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  39.36 
 
 		 372 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  39.35 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  38.05 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  37.81 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  38.24 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  37.91 
 
 		 365 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  37.16 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.41 
 
 		 403 aa  206  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  35.38 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  37.41 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  36.57 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  36.82 
 
 		 362 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  35.06 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.19 
 
 		 361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  40.1 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  40.1 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  36.71 
 
 		 362 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  36.71 
 
 		 362 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  34.99 
 
 		 393 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  35.07 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  36.83 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  36.83 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  36.83 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  36.83 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  36.83 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  36.2 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  35.59 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  36.23 
 
 		 363 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  37.02 
 
 		 372 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  36.9 
 
 		 363 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  35.49 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  36.28 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  36.41 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  37.16 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  37.3 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  35.32 
 
 		 366 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.26 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.87 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  35.33 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  35.32 
 
 		 366 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  35.33 
 
 		 364 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  35.33 
 
 		 364 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  35.33 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.63 
 
 		 356 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  38.38 
 
 		 380 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  35.22 
 
 		 381 aa  182  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.37 
 
 		 356 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  35.56 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  32.85 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.68 
 
 		 362 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  40.67 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  38.4 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.48 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.87 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  38.12 
 
 		 364 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  35.74 
 
 		 353 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  34.96 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  35.5 
 
 		 319 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  37.25 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  35.17 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.58 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.11 
 
 		 353 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  34.81 
 
 		 373 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  34.96 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  32.52 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  34.32 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  34.76 
 
 		 602 aa  159  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.7 
 
 		 576 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  32.54 
 
 		 384 aa  156  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  33.77 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.91 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.75 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  31.54 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  33.25 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  37.01 
 
 		 421 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  31.77 
 
 		 349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  35.51 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2522  cobalt-precorrin-6A synthase  37.88 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0994742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  35.25 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.17 
 
 		 365 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.43 
 
 		 382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.7 
 
 		 369 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.06 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  33.33 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  30.77 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  31.91 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.78 
 
 		 371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  30.5 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  28.04 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.13 
 
 		 350 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.01 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.36 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>