141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0622 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  100 
 
 		 383 aa  768    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  53.12 
 
 		 371 aa  328  9e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  39.17 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.61 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  40.87 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  40.87 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  40.87 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  40.87 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  40.87 
 
 		 364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  42.68 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  41.01 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  42.95 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  43.09 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  42.99 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  42.99 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  41.42 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  41.34 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  42.99 
 
 		 362 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  39.83 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  40.06 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.57 
 
 		 369 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  42.77 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.31 
 
 		 370 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  40.62 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  38.89 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  41.14 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  35.26 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.08 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.83 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  39.62 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  39.13 
 
 		 366 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.34 
 
 		 350 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  37.68 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  38.61 
 
 		 364 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  36.02 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  33.06 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  38.61 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  42.05 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  38.61 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.29 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  41.36 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  40.57 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.04 
 
 		 360 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  32.87 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.96 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.6 
 
 		 576 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  37.6 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  36.03 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  32.29 
 
 		 352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  32.41 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.7 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  38.49 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.19 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.34 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.42 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  34.57 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.69 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  33.05 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  34.88 
 
 		 365 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.81 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  35.73 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  34.88 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  39.94 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  36.56 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  37.6 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  34.73 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  36.74 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  39.51 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  36.16 
 
 		 371 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  40.99 
 
 		 364 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  38.54 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  34.55 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  34.05 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  33.7 
 
 		 379 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  33.7 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  33.7 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  33.7 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  34.81 
 
 		 393 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  33.7 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  37.86 
 
 		 421 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  32.69 
 
 		 366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  37.67 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.65 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  28.88 
 
 		 378 aa  142  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  34.51 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  36.57 
 
 		 602 aa  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.43 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.17 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  39.12 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.11 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.54 
 
 		 410 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.83 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.94 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  35.08 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  34.82 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  34.86 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.3 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  37.71 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.55 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>