143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1470 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 
365 aa  735    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  89.53 
 
 
365 aa  633  1e-180  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  86.85 
 
 
366 aa  566  1e-160  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  71.7 
 
 
369 aa  504  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  63.81 
 
 
378 aa  448  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  41.87 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  41.9 
 
 
381 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  36.72 
 
 
365 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  44.24 
 
 
365 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  40.7 
 
 
365 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  40.7 
 
 
365 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  39.03 
 
 
370 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  39.66 
 
 
352 aa  223  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.55 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  39.94 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.42 
 
 
384 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.36 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.5 
 
 
576 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.67 
 
 
382 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.21 
 
 
390 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.02 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  34.91 
 
 
383 aa  189  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  34.75 
 
 
379 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  34.75 
 
 
379 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  34.75 
 
 
379 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  34.75 
 
 
379 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  34.75 
 
 
379 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  33.06 
 
 
383 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.52 
 
 
481 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.44 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.5 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  32.39 
 
 
363 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.74 
 
 
370 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  32.21 
 
 
362 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  31.37 
 
 
362 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  31.65 
 
 
362 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  31.74 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  31.65 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  31.65 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 
363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 
363 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 
364 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 
364 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 
364 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  31.97 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  31.83 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.62 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  31.37 
 
 
363 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  31.77 
 
 
366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.6 
 
 
361 aa  162  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  35.33 
 
 
363 aa  162  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  31.56 
 
 
365 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  32.6 
 
 
365 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  34.1 
 
 
364 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.93 
 
 
356 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  33.55 
 
 
364 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  38.01 
 
 
366 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.62 
 
 
356 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.27 
 
 
349 aa  159  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  31.74 
 
 
366 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  34.3 
 
 
368 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  34.78 
 
 
388 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  34.43 
 
 
357 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.75 
 
 
403 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  30.15 
 
 
381 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.24 
 
 
362 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  33.44 
 
 
364 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  32.57 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  32.39 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  32.69 
 
 
381 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  30.82 
 
 
351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  31.63 
 
 
393 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  30.65 
 
 
392 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  32.1 
 
 
365 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.12 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.25 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  30.59 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  32.68 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  33.04 
 
 
388 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  33.67 
 
 
319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  32.01 
 
 
364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  33.86 
 
 
369 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  31.45 
 
 
373 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  31.61 
 
 
375 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.24 
 
 
369 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.08 
 
 
360 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  31.27 
 
 
413 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1053  cobalt-precorrin-6A synthase  31.99 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301385  hitchhiker  0.000449274 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  32.24 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  32.24 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1557  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.96 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  28.11 
 
 
437 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  30.59 
 
 
364 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  34.17 
 
 
372 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.62 
 
 
363 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  34.53 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  31.49 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  33.11 
 
 
380 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  35.33 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  29.97 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>