140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1297 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  100 
 
 		 392 aa  798    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  51.19 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  49.09 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  55.11 
 
 		 369 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  48.83 
 
 		 356 aa  326  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  50.65 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  40.62 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  43.67 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  40.31 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  37.95 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.59 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  38.11 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  38.21 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  36.81 
 
 		 363 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  38.36 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  36.36 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  39.29 
 
 		 353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  35.88 
 
 		 364 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  36.71 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  33.97 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  37.59 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  36.71 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  35.65 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  36.71 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  36.71 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  41.35 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  36.71 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.89 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.46 
 
 		 361 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  36.87 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  35.67 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  43.88 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  36.18 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  39.06 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  36.06 
 
 		 372 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  36.23 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.36 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  38.27 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  37.18 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  39.65 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  35.94 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  36.23 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  37.17 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  36.23 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.79 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  36.23 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  36.23 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  38.78 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  39.41 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  40.78 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  40.06 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  40.06 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.86 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  36.8 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  40 
 
 		 357 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  35.89 
 
 		 365 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.46 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  36.49 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  34.56 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.03 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  38.77 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  39.64 
 
 		 357 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  38.71 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  39.16 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.89 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  36.21 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.56 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.46 
 
 		 576 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  40.92 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  32.28 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  38.21 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  38.24 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  32.28 
 
 		 365 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.11 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  37.95 
 
 		 368 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1978  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  37.41 
 
 		 489 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  37.22 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  37.03 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  34.64 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  36.87 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  36.54 
 
 		 319 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.97 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  39.3 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  31.2 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.38 
 
 		 358 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.16 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  35.91 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  31.31 
 
 		 437 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.21 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.87 
 
 		 350 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  37.12 
 
 		 349 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  30.65 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  34.64 
 
 		 379 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  34.64 
 
 		 379 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  34.64 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  34.64 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  34.64 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  30.85 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.72 
 
 		 359 aa  143  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  32.04 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>