143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0387 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 
365 aa  733    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  89.53 
 
 
365 aa  633  1e-180  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  90.11 
 
 
366 aa  591  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  73.61 
 
 
369 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  62.77 
 
 
378 aa  437  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  41 
 
 
373 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  40.98 
 
 
381 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.75 
 
 
365 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  35.77 
 
 
365 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  40.64 
 
 
365 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  40.64 
 
 
365 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  40.28 
 
 
366 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  37.89 
 
 
370 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.33 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  42.86 
 
 
352 aa  219  5e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.03 
 
 
369 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.27 
 
 
576 aa  216  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.52 
 
 
384 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.03 
 
 
382 aa  200  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.13 
 
 
359 aa  192  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  35.42 
 
 
383 aa  192  9e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  32.41 
 
 
383 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  33.9 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  33.9 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  33.9 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  33.9 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  33.9 
 
 
379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.51 
 
 
390 aa  182  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  32.39 
 
 
363 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.08 
 
 
481 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 
363 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 
363 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 
364 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 
364 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  32.77 
 
 
364 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  33.54 
 
 
362 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.32 
 
 
358 aa  175  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  32.87 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.55 
 
 
370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  33.54 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  33.54 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  33.54 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  32.3 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  33.54 
 
 
362 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  33.54 
 
 
362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.52 
 
 
350 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  31.55 
 
 
370 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  38.01 
 
 
366 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  36.9 
 
 
363 aa  169  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  37.27 
 
 
366 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  32.14 
 
 
372 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  33.74 
 
 
357 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  33.88 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.71 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.25 
 
 
369 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  32.78 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  33.33 
 
 
364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  32.11 
 
 
365 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.53 
 
 
356 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.24 
 
 
362 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  30.85 
 
 
392 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  35.26 
 
 
365 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.87 
 
 
403 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.53 
 
 
356 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.55 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  33.66 
 
 
364 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  33.55 
 
 
364 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  33 
 
 
319 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.02 
 
 
353 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  32.22 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  32.19 
 
 
364 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  32.04 
 
 
368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  33.33 
 
 
369 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  29.5 
 
 
381 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  31.75 
 
 
376 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  30.97 
 
 
393 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  31.59 
 
 
365 aa  149  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  31.59 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.05 
 
 
360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.37 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  32.04 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  32.11 
 
 
385 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  31.44 
 
 
388 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  30.4 
 
 
364 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  30.27 
 
 
413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.12 
 
 
371 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  35.47 
 
 
372 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  29.49 
 
 
376 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.6 
 
 
369 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  30.7 
 
 
351 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  26.52 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  29.54 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  30.25 
 
 
375 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1053  cobalt-precorrin-6A synthase  33.01 
 
 
370 aa  139  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301385  hitchhiker  0.000449274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  30.11 
 
 
373 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  31.1 
 
 
349 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  32.33 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  31.65 
 
 
341 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  29.97 
 
 
371 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  35.74 
 
 
365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>