143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2101 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  100 
 
 
382 aa  771    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  38.31 
 
 
381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  40.56 
 
 
370 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  37.29 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  39.94 
 
 
365 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  38.57 
 
 
366 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.51 
 
 
365 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  34.75 
 
 
365 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  36.65 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  36.65 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  36.65 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  36.65 
 
 
379 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  36.65 
 
 
379 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  40.66 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.21 
 
 
369 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.42 
 
 
385 aa  192  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  36.07 
 
 
378 aa  192  9e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.71 
 
 
384 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  34.79 
 
 
369 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  35.08 
 
 
383 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  33.9 
 
 
365 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.14 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.05 
 
 
361 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  33.62 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.35 
 
 
358 aa  179  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.08 
 
 
576 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.03 
 
 
359 aa  176  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  37.94 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  29.69 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.33 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  32.39 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  29.78 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  29.69 
 
 
364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  29.69 
 
 
364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  29.78 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.14 
 
 
370 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  34.73 
 
 
366 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.52 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.64 
 
 
481 aa  172  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  32.95 
 
 
365 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  29.21 
 
 
363 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.11 
 
 
349 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  33.75 
 
 
365 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  31.45 
 
 
413 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  32 
 
 
364 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  33.44 
 
 
365 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  29.71 
 
 
370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  31.43 
 
 
364 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  29.6 
 
 
319 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.14 
 
 
353 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  30.03 
 
 
413 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  32.15 
 
 
365 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  29.14 
 
 
362 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  31.13 
 
 
372 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  29.71 
 
 
362 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  31.05 
 
 
364 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  31.05 
 
 
364 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  28.86 
 
 
362 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  29.14 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  29.14 
 
 
363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  29.14 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  33.83 
 
 
366 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  37.79 
 
 
336 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  33.88 
 
 
364 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  33.46 
 
 
366 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  33.88 
 
 
364 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  28.41 
 
 
362 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  30.68 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  31.18 
 
 
393 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  34.81 
 
 
351 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.67 
 
 
369 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  29.13 
 
 
366 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  32.2 
 
 
372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  38.08 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  31.91 
 
 
365 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.23 
 
 
403 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  30.19 
 
 
373 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  34.33 
 
 
388 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  35.17 
 
 
384 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  28 
 
 
437 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  31.01 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  36.19 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  34.43 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  29.01 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.83 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  28.7 
 
 
353 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  32.06 
 
 
392 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  35.74 
 
 
365 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  33.61 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  29.91 
 
 
421 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.51 
 
 
362 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1716  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.93 
 
 
362 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.3857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  29.91 
 
 
357 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.94 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  32.27 
 
 
376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.94 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.43 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  32.1 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  32.58 
 
 
369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  29.14 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>