137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1978 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1978  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  100 
 
 		 489 aa  979    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  48.94 
 
 		 351 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  45.7 
 
 		 410 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  40 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.793158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.95 
 
 		 437 aa  213  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1716  cobalamin biosynthesis protein CbiD  50.56 
 
 		 362 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.3857  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  36.89 
 
 		 413 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  41.36 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  44.98 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  40.89 
 
 		 367 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  40.89 
 
 		 367 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  40.89 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  40.52 
 
 		 373 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  38.6 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.08 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  40.97 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  38.62 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  39.73 
 
 		 375 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  39.03 
 
 		 365 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  37.39 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  39.63 
 
 		 381 aa  176  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.77 
 
 		 356 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  40.94 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.63 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.25 
 
 		 356 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  41.09 
 
 		 388 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.77 
 
 		 362 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  38.07 
 
 		 380 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  37.5 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  38.53 
 
 		 362 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  38.53 
 
 		 363 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  39.53 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  39.53 
 
 		 363 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  39.53 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.03 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  39.52 
 
 		 363 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  39.53 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  39.53 
 
 		 364 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  39.53 
 
 		 364 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  38.14 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  38.14 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  38.14 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  38.14 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  34.27 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  36.33 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  37.06 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  38.41 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  37.08 
 
 		 364 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  35.98 
 
 		 368 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  38.38 
 
 		 366 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  40.47 
 
 		 366 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  38.43 
 
 		 371 aa  156  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.53 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  37.58 
 
 		 362 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.7 
 
 		 353 aa  154  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  35.76 
 
 		 364 aa  153  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.43 
 
 		 370 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  35.57 
 
 		 365 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  38.75 
 
 		 370 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.58 
 
 		 576 aa  151  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  36.78 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  37.79 
 
 		 381 aa  150  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  39.46 
 
 		 364 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  38.66 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.55 
 
 		 363 aa  147  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  36.7 
 
 		 357 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  36.31 
 
 		 349 aa  146  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  34.04 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  38.7 
 
 		 364 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  37.96 
 
 		 364 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  32.5 
 
 		 383 aa  143  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  38.31 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  39.22 
 
 		 365 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  34.65 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.82 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  34.22 
 
 		 353 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  35.21 
 
 		 602 aa  140  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.29 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  36.86 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  34.03 
 
 		 373 aa  137  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  35.05 
 
 		 376 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.64 
 
 		 358 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  34.88 
 
 		 370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  33.44 
 
 		 384 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.54 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  35.78 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  33.56 
 
 		 366 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  32.58 
 
 		 365 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.4 
 
 		 385 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  35.47 
 
 		 368 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  32.26 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.82 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.45 
 
 		 365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.84 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.14 
 
 		 359 aa  127  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  32.69 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.74 
 
 		 382 aa  126  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.8 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.26 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.56 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>