141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2080 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 		 371 aa  754    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  42.54 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  42.18 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  45.02 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  42.61 
 
 		 362 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  42.61 
 
 		 362 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  39.83 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  43.23 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  44.37 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  45.05 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  41.99 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.28 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  41.62 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  45.78 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  45.13 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  38.57 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  41.76 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  43.59 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  43.59 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  43.59 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  43.59 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  43.59 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  41.73 
 
 		 413 aa  232  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  41.25 
 
 		 413 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  43.45 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  41.85 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  42.02 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  42.02 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.58 
 
 		 403 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  43.98 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  38.27 
 
 		 364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  38.59 
 
 		 364 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  46.32 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  40.92 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  40.92 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  40.62 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.4 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  44.16 
 
 		 319 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  38.04 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  46.15 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  40.71 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  40.22 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  39.73 
 
 		 373 aa  199  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  41.46 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  42.62 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  39.5 
 
 		 365 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  40.37 
 
 		 357 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  36.86 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  39.24 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.05 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.24 
 
 		 410 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  37.5 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.72 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  37.6 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  40 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  37.27 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.42 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  40.68 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  38.35 
 
 		 357 aa  179  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.59 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  34.86 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  41.32 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.11 
 
 		 356 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.5 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  40.07 
 
 		 421 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  43.28 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.8 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  33.98 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.11 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  35.77 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2522  cobalt-precorrin-6A synthase  43.52 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0994742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  36.29 
 
 		 364 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  33.33 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.64 
 
 		 576 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  33.33 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  40.3 
 
 		 602 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  38.65 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  30.24 
 
 		 437 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  38.38 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  34.87 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.58 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1978  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  38.43 
 
 		 489 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.72 
 
 		 358 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.43 
 
 		 369 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  40.93 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.09 
 
 		 384 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.38 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  32.75 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  35.74 
 
 		 381 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  32.2 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1716  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.49 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.3857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.89 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  33.22 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.55 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  32.89 
 
 		 365 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.1 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.31 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.23 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.98 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.81 
 
 		 481 aa  132  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>