143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0117 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  100 
 
 
349 aa  701    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  50 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  46.36 
 
 
336 aa  247  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.05 
 
 
390 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  39.86 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37 
 
 
385 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  35.36 
 
 
363 aa  172  6.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.09 
 
 
384 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.11 
 
 
382 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.43 
 
 
365 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.11 
 
 
576 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  34.64 
 
 
383 aa  162  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  34.27 
 
 
365 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  37.8 
 
 
366 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  35.16 
 
 
379 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  35.16 
 
 
379 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  35.16 
 
 
379 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  35.16 
 
 
379 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  35.19 
 
 
352 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  34.87 
 
 
379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32 
 
 
358 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  30.3 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  38.49 
 
 
353 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  34.55 
 
 
365 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  33.05 
 
 
373 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.44 
 
 
369 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  35.61 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  35.31 
 
 
365 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  34.19 
 
 
369 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  31.41 
 
 
370 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  33.52 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.36 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.02 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.05 
 
 
356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.47 
 
 
481 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  34.84 
 
 
366 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.29 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.58 
 
 
371 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  31.28 
 
 
367 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  31.28 
 
 
367 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  29.57 
 
 
388 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  29.3 
 
 
392 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.25 
 
 
356 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  34.78 
 
 
365 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3215  cobalt-precorrin-6A synthase  38.43 
 
 
335 aa  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  33.15 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  30.03 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  31.64 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  30.6 
 
 
413 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  32.66 
 
 
364 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  30.85 
 
 
413 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  35.4 
 
 
364 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  31.27 
 
 
364 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  31.27 
 
 
364 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0142  cobalt-precorrin-6A synthase  35.43 
 
 
344 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.712011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  31.27 
 
 
364 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.97 
 
 
362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  30.83 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  30.47 
 
 
365 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.48 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  31.11 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  32.16 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  29.14 
 
 
370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.69 
 
 
403 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  32.3 
 
 
369 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  33.71 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  29.43 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  28.73 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0295  cobalt-precorrin-6A synthase  30.42 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0309656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  30.39 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.21 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  30.49 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1493  cobalt-precorrin-6A synthase  35.09 
 
 
339 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  30.86 
 
 
353 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  35.09 
 
 
369 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  36.98 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  31.47 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  32.51 
 
 
362 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  32.51 
 
 
362 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  32.71 
 
 
364 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.81 
 
 
370 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  32.71 
 
 
363 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  32.71 
 
 
363 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  31.46 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  30.16 
 
 
366 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  32.71 
 
 
364 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  32.71 
 
 
364 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  33.21 
 
 
388 aa  109  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  32.51 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  32.36 
 
 
357 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  32.16 
 
 
363 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2363  cobalt-precorrin-6A synthase  28.09 
 
 
384 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  29.53 
 
 
365 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  29.36 
 
 
381 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  30.25 
 
 
365 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.46 
 
 
367 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  32.34 
 
 
384 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  31.62 
 
 
357 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  30.13 
 
 
365 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  28.07 
 
 
373 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0736251 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>