117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0041 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0041  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 		 362 aa  709    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0045  cobalt-precorrin-6A synthase  69.32 
 
 		 368 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00441  cobalt-precorrin-6A synthase  61.83 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00341  cobalt-precorrin-6A synthase  48.34 
 
 		 381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.136591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1362  cobalt-precorrin-6A synthase  47.67 
 
 		 381 aa  332  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00361  cobalt-precorrin-6A synthase  51.31 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  40.16 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  39.67 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0036  cobalt-precorrin-6A synthase  41.27 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270806  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  40.56 
 
 		 372 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2363  cobalt-precorrin-6A synthase  40.67 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0295  cobalt-precorrin-6A synthase  41.03 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0309656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1053  cobalt-precorrin-6A synthase  40.44 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301385  hitchhiker  0.000449274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0190  cobalt-precorrin-6A synthase  44.51 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0905  cobalt-precorrin-6A synthase  39.27 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.762763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2413  cobalt-precorrin-6A synthase  40.39 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  38.54 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1557  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.56 
 
 		 371 aa  219  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.72 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  30.32 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  23.83 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  26.89 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  26.52 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  28.42 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.12 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.76 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  27.3 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  31.56 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  29.84 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  29.84 
 
 		 379 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  29.84 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  29.84 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  30.48 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  29.51 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  28.11 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  27.76 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  22.77 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  32.94 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  28.34 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.37 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  27.38 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  26.87 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.46 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.36 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.47 
 
 		 576 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.71 
 
 		 481 aa  72.8  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  28.69 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  23.44 
 
 		 383 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.82 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  28.71 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.27 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.92 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  24.5 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  26.32 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.2 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  26.12 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  28.29 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  27.76 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.27 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  27.44 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  25.08 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  26.6 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.02 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  27.31 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.1 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  27.31 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  27.31 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  27.31 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  27.59 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  27.31 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  27.03 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  27.2 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  24.75 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  26.06 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.16 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  27.65 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  29.36 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  29.36 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  22.54 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  27.56 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  26.91 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  25.98 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  27.03 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.19 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.56 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  26.91 
 
 		 362 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  26.91 
 
 		 362 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  25.25 
 
 		 375 aa  53.1  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  23.81 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  26.79 
 
 		 365 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  26.51 
 
 		 362 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.65 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  26.54 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  26.91 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  26.87 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  26.87 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  25.98 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  27.82 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.02 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  27.48 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>