84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0036 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0036  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 		 362 aa  728    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270806  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  86.74 
 
 		 370 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  86.46 
 
 		 362 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  69.34 
 
 		 372 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00361  cobalt-precorrin-6A synthase  48.86 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00441  cobalt-precorrin-6A synthase  43.17 
 
 		 386 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1362  cobalt-precorrin-6A synthase  45.11 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00341  cobalt-precorrin-6A synthase  45.11 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.136591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0041  cobalt-precorrin-6A synthase  41 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0045  cobalt-precorrin-6A synthase  42.3 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2363  cobalt-precorrin-6A synthase  39.64 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  37.06 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0295  cobalt-precorrin-6A synthase  36.62 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0309656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2413  cobalt-precorrin-6A synthase  37.57 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0905  cobalt-precorrin-6A synthase  36.73 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.762763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0190  cobalt-precorrin-6A synthase  34.53 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1053  cobalt-precorrin-6A synthase  33.62 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301385  hitchhiker  0.000449274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1557  cobalamin biosynthesis protein CbiD  35.35 
 
 		 371 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.29 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  27.54 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  27.76 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  29.96 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.23 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  26.87 
 
 		 363 aa  96.3  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  32.27 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.77 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.73 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  26.71 
 
 		 381 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  26.45 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  30.04 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.76 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  29.47 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  30.66 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  26.41 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  27.64 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.78 
 
 		 576 aa  80.1  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  26.06 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  26.39 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  28.57 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.5 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.54 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.88 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  25.23 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.41 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  31.01 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  28.31 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  22.68 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  31.01 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  31.01 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  31.01 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.26 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.74 
 
 		 481 aa  62.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  30.23 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.57 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.57 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.03 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  23.35 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  23.53 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  26.34 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  23.2 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  23.21 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  29.11 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.7 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  22.32 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  25.58 
 
 		 437 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.34 
 
 		 403 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.17 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.49 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  22.73 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  25.41 
 
 		 393 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  23.5 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  26.75 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.61 
 
 		 360 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  26.75 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  20 
 
 		 370 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  21.79 
 
 		 368 aa  46.2  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  24.54 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.57 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  27.32 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  23.91 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  21.58 
 
 		 351 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  22.39 
 
 		 366 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  25.88 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  21.33 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>