101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0045 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0045  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 
368 aa  723    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0041  cobalt-precorrin-6A synthase  69.32 
 
 
362 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00441  cobalt-precorrin-6A synthase  59.41 
 
 
386 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00361  cobalt-precorrin-6A synthase  51.45 
 
 
361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1362  cobalt-precorrin-6A synthase  45.43 
 
 
381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00341  cobalt-precorrin-6A synthase  45.43 
 
 
381 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.136591  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  40.88 
 
 
370 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  41.35 
 
 
372 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0036  cobalt-precorrin-6A synthase  41.46 
 
 
362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270806  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00351  cobalt-precorrin-6A synthase  40.62 
 
 
362 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2363  cobalt-precorrin-6A synthase  39.33 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5223  cobalt-precorrin-6A synthase  41.24 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0905  cobalt-precorrin-6A synthase  39.64 
 
 
385 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.762763  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0295  cobalt-precorrin-6A synthase  40.87 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0309656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2413  cobalt-precorrin-6A synthase  38.8 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1053  cobalt-precorrin-6A synthase  40.28 
 
 
370 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301385  hitchhiker  0.000449274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1557  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.95 
 
 
371 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0190  cobalt-precorrin-6A synthase  43.02 
 
 
374 aa  199  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.99 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  28.06 
 
 
365 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  27.42 
 
 
365 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.28 
 
 
385 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  24.38 
 
 
352 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  30.8 
 
 
381 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  29.77 
 
 
373 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1595  cobalt-precorrin-6A synthase  25.88 
 
 
363 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  24.4 
 
 
390 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  28.9 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  29.41 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2101  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.04 
 
 
382 aa  89  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.753139  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  29.61 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0040  cobalt-precorrin-6A synthase  27.62 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  31.86 
 
 
379 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  31.86 
 
 
379 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  31.86 
 
 
379 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  30.22 
 
 
365 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  31.86 
 
 
379 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  31.86 
 
 
379 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.19 
 
 
576 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0117  cobalamin biosynthesis protein CbiD  26.48 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  29.9 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  25.94 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0052  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.42 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  27.46 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.86 
 
 
384 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1524  cobalt-precorrin-6A synthase  29.77 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00016517 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0450  cobalt-precorrin-6A synthase  34.16 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.350149  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  27.89 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.3 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.44 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0298  cobalt-precorrin-6A synthase  28.8 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.921806  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  27.31 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  30.6 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.49 
 
 
403 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.87 
 
 
350 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  26.9 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  29.03 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  21.03 
 
 
361 aa  57  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  24.93 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.93 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  27.01 
 
 
362 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  27.01 
 
 
362 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  28.02 
 
 
363 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  27.16 
 
 
365 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  30.92 
 
 
369 aa  52.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  26.28 
 
 
362 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  27.31 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  28.29 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  27.16 
 
 
372 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  27.78 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  27.23 
 
 
366 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  29.61 
 
 
437 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  26.12 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  26.02 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  26.12 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  26.12 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  26.12 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.5 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  26.2 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  29.25 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  26.12 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  25.75 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  28.5 
 
 
366 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  27.01 
 
 
362 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.19 
 
 
362 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.01 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  27.6 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  25.26 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  24.36 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  28.68 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  25.48 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  26.64 
 
 
602 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  20.34 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  24.2 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  26.29 
 
 
375 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  26.47 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  27.06 
 
 
366 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  27.52 
 
 
365 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  28.57 
 
 
365 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  28.41 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>