More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74654 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_74654  quinone oxidoreductase  100 
 
 
364 aa  740    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.907908  normal  0.0207844 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28468  quinone oxidoreductase  43.72 
 
 
362 aa  299  6e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00993002  normal  0.0416913 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07199  conserved hypothetical protein  41.27 
 
 
371 aa  246  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.528033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  38.99 
 
 
334 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  38.1 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.6 
 
 
338 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
338 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
338 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
338 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.99 
 
 
335 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05880  cytoplasm protein, putative  36.94 
 
 
344 aa  188  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  38.69 
 
 
386 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.66 
 
 
341 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
335 aa  187  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.8 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  37.69 
 
 
353 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
333 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.71 
 
 
349 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  36.34 
 
 
479 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  36.34 
 
 
427 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  37.58 
 
 
336 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  36.34 
 
 
422 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  36.34 
 
 
406 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  36.34 
 
 
469 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  35.1 
 
 
331 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.52 
 
 
338 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.79 
 
 
338 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.52 
 
 
338 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
333 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  34.89 
 
 
341 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.56 
 
 
344 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.5 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0909  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.77 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.27 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.27 
 
 
336 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.15 
 
 
337 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  36.26 
 
 
339 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.5 
 
 
334 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
336 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
332 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
338 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.52 
 
 
333 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
341 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.57 
 
 
337 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.09 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1097  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
337 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
336 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
338 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.76 
 
 
338 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
332 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.53 
 
 
344 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
339 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.94 
 
 
341 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1674  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
332 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568438  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36 
 
 
338 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
347 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 
332 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.96 
 
 
332 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 
333 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03835  predicted NADP-dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
332 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0444273  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 
333 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3470  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
336 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  36.34 
 
 
340 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
339 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.66 
 
 
332 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.79 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
338 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 
334 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
339 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.22 
 
 
340 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
332 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
339 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3516  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.94 
 
 
340 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
339 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2403  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
332 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.72 
 
 
346 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
338 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.73 
 
 
338 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 
339 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
334 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
334 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2060  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
332 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.881671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.54 
 
 
341 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
340 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
332 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  32.5 
 
 
332 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>