More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03835 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03835  predicted NADP-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 332 aa  682    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0444273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2060  alcohol dehydrogenase  68.98 
 
 		 332 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.881671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1674  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.87 
 
 		 332 aa  477  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568438  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2403  alcohol dehydrogenase  62.95 
 
 		 332 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0909  alcohol dehydrogenase  54.85 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  41.89 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.41 
 
 		 341 aa  275  8e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.72 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  43.47 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.12 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.19 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.9 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.38 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.4 
 
 		 349 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.6 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.6 
 
 		 336 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  39.47 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.89 
 
 		 337 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  39.1 
 
 		 386 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  41.96 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.76 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  39.82 
 
 		 343 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  41.59 
 
 		 336 aa  252  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.66 
 
 		 345 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  40.36 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  38.81 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.36 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  40 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40.36 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  40.36 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.36 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  40.36 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.39 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  43.85 
 
 		 337 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.76 
 
 		 347 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  39.58 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  42.25 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  43.52 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  38.81 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.21 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.76 
 
 		 345 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 		 331 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.62 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.46 
 
 		 345 aa  242  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  38.94 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  40.73 
 
 		 332 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.6 
 
 		 342 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  38.78 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.42 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.19 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.99 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.5 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.22 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 		 332 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.12 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  38.32 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  38.62 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  38.32 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  38.32 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.22 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  38.62 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 		 332 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.71 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 341 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  38.05 
 
 		 342 aa  235  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.64 
 
 		 341 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05880  cytoplasm protein, putative  37.99 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 		 347 aa  235  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  39 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  37.69 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  40.83 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.31 
 
 		 342 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  37.95 
 
 		 332 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>