More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2403 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2403  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 332 aa  679    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2060  alcohol dehydrogenase  75.9 
 
 		 332 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.881671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1674  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.77 
 
 		 332 aa  478  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03835  predicted NADP-dependent oxidoreductase  62.95 
 
 		 332 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0444273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0909  alcohol dehydrogenase  56.97 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.41 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  42.25 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.99 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  41.64 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.55 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.28 
 
 		 341 aa  261  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.73 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.47 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.61 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.57 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  40.24 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.15 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.32 
 
 		 336 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.46 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  42.56 
 
 		 336 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.31 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  43.07 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  41.95 
 
 		 331 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 		 337 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  41.95 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.22 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.25 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 		 332 aa  242  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 		 349 aa  242  5e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  40.12 
 
 		 345 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 		 337 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.07 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  39.53 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.47 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  41.28 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.59 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 		 332 aa  238  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  40.96 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.69 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  41.35 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  39.16 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  38.94 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.67 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  39.1 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 		 339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  40.54 
 
 		 338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  40.55 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.39 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.67 
 
 		 345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.21 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 332 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.02 
 
 		 341 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.57 
 
 		 332 aa  232  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  39.53 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  41.99 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  41.99 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.99 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  41.99 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.99 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  41.19 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  41.99 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  40.6 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  41.99 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.37 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  38.37 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.37 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  38.37 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.83 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  38.07 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  38.72 
 
 		 332 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  38.07 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.75 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>