47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49258 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  100 
 
 
1167 aa  2428    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  36.12 
 
 
576 aa  309  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  30.31 
 
 
879 aa  253  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  28.06 
 
 
1060 aa  244  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  31.16 
 
 
1039 aa  241  6.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  28.53 
 
 
1010 aa  208  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  26.6 
 
 
785 aa  203  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  27.87 
 
 
703 aa  177  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  25.84 
 
 
860 aa  176  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  31.02 
 
 
537 aa  174  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  26.37 
 
 
784 aa  174  7.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  26.87 
 
 
709 aa  172  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  27.71 
 
 
862 aa  164  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  25.08 
 
 
918 aa  151  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  27.35 
 
 
705 aa  144  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  29.47 
 
 
447 aa  144  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  27.25 
 
 
712 aa  143  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  24.64 
 
 
1122 aa  138  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  26.59 
 
 
886 aa  138  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  24.9 
 
 
994 aa  135  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  23.94 
 
 
575 aa  130  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41008  predicted protein  25.77 
 
 
823 aa  124  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43575  predicted protein  25.83 
 
 
737 aa  122  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835069  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  23.36 
 
 
1040 aa  114  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34138  predicted protein  26.91 
 
 
647 aa  112  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43112  predicted protein  24.49 
 
 
708 aa  107  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  27.54 
 
 
428 aa  99.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  23.15 
 
 
775 aa  92.8  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.56 
 
 
377 aa  88.6  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  26.28 
 
 
744 aa  84.7  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  26.53 
 
 
1225 aa  74.7  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48215  predicted protein  21.44 
 
 
879 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  26.57 
 
 
700 aa  70.1  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.64 
 
 
632 aa  65.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44221  predicted protein  33.33 
 
 
249 aa  63.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44880  predicted protein  20.87 
 
 
717 aa  60.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  24 
 
 
683 aa  59.7  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24 
 
 
629 aa  59.3  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  22.27 
 
 
739 aa  59.3  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  22.27 
 
 
739 aa  59.3  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  22.29 
 
 
1464 aa  58.9  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  26.42 
 
 
1373 aa  53.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  25.72 
 
 
439 aa  53.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  25.33 
 
 
889 aa  52.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48455  predicted protein  20.45 
 
 
614 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  24.12 
 
 
536 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33495  hypothetical protein  22.83 
 
 
741 aa  45.8  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375404  normal  0.0265895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>