39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49642 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  100 
 
 
705 aa  1462    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  26.6 
 
 
1167 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  25.98 
 
 
576 aa  144  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  22.66 
 
 
784 aa  114  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  25.54 
 
 
537 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  29.17 
 
 
1060 aa  107  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  22.75 
 
 
709 aa  107  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  24.75 
 
 
785 aa  103  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  21.1 
 
 
879 aa  100  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  21.45 
 
 
575 aa  99  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  27.98 
 
 
1010 aa  87  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  26.54 
 
 
1039 aa  85.5  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  25.99 
 
 
428 aa  84  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  24.06 
 
 
703 aa  82.8  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  23.33 
 
 
860 aa  81.6  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  22.81 
 
 
918 aa  75.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  23.01 
 
 
712 aa  75.1  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  21 
 
 
862 aa  72  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  23.57 
 
 
1040 aa  71.2  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  26.71 
 
 
1122 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  23.67 
 
 
886 aa  67.8  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43575  predicted protein  21.23 
 
 
737 aa  60.8  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835069  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41008  predicted protein  23.68 
 
 
823 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  25 
 
 
447 aa  58.2  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  27.52 
 
 
1373 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  22.84 
 
 
377 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34138  predicted protein  22.29 
 
 
647 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  24.9 
 
 
683 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.9 
 
 
629 aa  55.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43112  predicted protein  22.19 
 
 
708 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  25 
 
 
775 aa  50.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48215  predicted protein  23.18 
 
 
879 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  22.73 
 
 
744 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  23.03 
 
 
994 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  26.53 
 
 
536 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48455  predicted protein  22.4 
 
 
614 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  34.04 
 
 
739 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  20.7 
 
 
632 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  34.04 
 
 
739 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>