46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29142 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  100 
 
 		 632 aa  1301    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  27.24 
 
 		 744 aa  100  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  22.37 
 
 		 889 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.75 
 
 		 377 aa  88.6  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  24.51 
 
 		 700 aa  85.9  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  26.91 
 
 		 1225 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  27.17 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 		 1464 aa  80.1  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  27.88 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  24.69 
 
 		 1039 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05560  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 		 1317 aa  68.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104177  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  22.55 
 
 		 1167 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29163  predicted protein  29.55 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0206016  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  28.1 
 
 		 1272 aa  64.7  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  23.68 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  28.57 
 
 		 1373 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  21.34 
 
 		 683 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92797  predicted protein  28.26 
 
 		 837 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189677  normal  0.345791 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.34 
 
 		 629 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  24.37 
 
 		 1040 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  24.15 
 
 		 918 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24879  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  36.9 
 
 		 424 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  24.68 
 
 		 879 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  22.35 
 
 		 447 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  25.93 
 
 		 712 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  24 
 
 		 576 aa  54.3  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50411  predicted protein  24.88 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.918794  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44446  predicted protein  26.19 
 
 		 1354 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  27.66 
 
 		 414 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01300  conserved hypothetical protein  25.32 
 
 		 760 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00232907  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01800  conserved hypothetical protein  24.1 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  25 
 
 		 1060 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50546  predicted protein  25.53 
 
 		 705 aa  50.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.93 
 
 		 739 aa  50.8  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  21.93 
 
 		 739 aa  50.8  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  29.14 
 
 		 860 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  25.81 
 
 		 886 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  23.32 
 
 		 862 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  21.75 
 
 		 709 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39052  predicted protein  34.25 
 
 		 481 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44794  predicted protein  27.98 
 
 		 973 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30689  predicted protein  26.23 
 
 		 775 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00144758  normal  0.461418 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  24.04 
 
 		 1122 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31465  predicted protein  25.69 
 
 		 580 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  26.73 
 
 		 575 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  30.3 
 
 		 784 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>