53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_2458 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  100 
 
 
377 aa  768    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.76 
 
 
629 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  25.76 
 
 
683 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  24.27 
 
 
744 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  30.31 
 
 
1225 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.75 
 
 
632 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  24.81 
 
 
1167 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  23.96 
 
 
536 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  24.36 
 
 
712 aa  77  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  24.16 
 
 
918 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  24.08 
 
 
889 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01300  conserved hypothetical protein  28.82 
 
 
760 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00232907  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05560  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 
1317 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104177  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  21.85 
 
 
700 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  24.63 
 
 
879 aa  70.5  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  24.74 
 
 
1272 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  20.8 
 
 
576 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  23.62 
 
 
1464 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.55 
 
 
444 aa  66.2  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  28.32 
 
 
1373 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  23.18 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  33.57 
 
 
428 aa  63.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50411  predicted protein  26.92 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.918794  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  21.93 
 
 
860 aa  59.7  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  26.29 
 
 
784 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  25.22 
 
 
1039 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  22.3 
 
 
785 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  26.07 
 
 
1010 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14603  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.95 
 
 
792 aa  56.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0183985 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  26.2 
 
 
886 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  20.51 
 
 
1060 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43112  predicted protein  20.91 
 
 
708 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  21.27 
 
 
575 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01800  conserved hypothetical protein  23.12 
 
 
551 aa  53.5  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31465  predicted protein  29.51 
 
 
580 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33495  hypothetical protein  21.35 
 
 
741 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375404  normal  0.0265895 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44446  predicted protein  25.31 
 
 
1354 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  29.45 
 
 
447 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  23.17 
 
 
705 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05927  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10790)  33.04 
 
 
824 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  26.34 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  26.53 
 
 
862 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9534  predicted protein  27.27 
 
 
101 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  21.16 
 
 
709 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29163  predicted protein  26.46 
 
 
505 aa  46.2  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0206016  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92797  predicted protein  21.25 
 
 
837 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189677  normal  0.345791 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  22.59 
 
 
703 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25292  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.08 
 
 
775 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.025628 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50546  predicted protein  28.72 
 
 
705 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  21.25 
 
 
739 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  25.57 
 
 
1122 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.25 
 
 
739 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44794  predicted protein  27.33 
 
 
973 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>