36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43645 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  100 
 
 
862 aa  1799    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  26.71 
 
 
1039 aa  207  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  27.71 
 
 
1167 aa  166  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  25.49 
 
 
1010 aa  134  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  23.28 
 
 
879 aa  130  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  24.31 
 
 
785 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  24.68 
 
 
703 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  24.32 
 
 
1060 aa  121  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  26.84 
 
 
576 aa  118  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  24.01 
 
 
1040 aa  108  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  22.18 
 
 
860 aa  108  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  24.64 
 
 
886 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  23.39 
 
 
1122 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  21.05 
 
 
918 aa  95.5  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  25 
 
 
712 aa  95.1  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  24.79 
 
 
994 aa  89.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  26.15 
 
 
709 aa  86.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  25.99 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41008  predicted protein  24.54 
 
 
823 aa  80.9  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  26.05 
 
 
537 aa  79  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  21.32 
 
 
784 aa  79  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  21 
 
 
705 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  27.75 
 
 
1373 aa  62  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  22.66 
 
 
428 aa  58.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  23.04 
 
 
775 aa  57.8  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34138  predicted protein  22.34 
 
 
647 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  18.73 
 
 
575 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43112  predicted protein  27.52 
 
 
708 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  23.51 
 
 
439 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  22.18 
 
 
629 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  26.03 
 
 
744 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  22.18 
 
 
683 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48215  predicted protein  19.63 
 
 
879 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.32 
 
 
632 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  26.53 
 
 
377 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43575  predicted protein  19.74 
 
 
737 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>