26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30981 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  100 
 
 
439 aa  914    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  27.27 
 
 
444 aa  88.2  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  25.93 
 
 
700 aa  83.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  26.74 
 
 
1225 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  24.16 
 
 
744 aa  67.4  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.18 
 
 
377 aa  65.1  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.68 
 
 
632 aa  63.2  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  26.27 
 
 
536 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44446  predicted protein  27.01 
 
 
1354 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01300  conserved hypothetical protein  25.62 
 
 
760 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00232907  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  33.7 
 
 
889 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  25.27 
 
 
1167 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  21.33 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  25.56 
 
 
683 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.56 
 
 
629 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  23.51 
 
 
862 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04433  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07240)  22.51 
 
 
816 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  22.77 
 
 
1373 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05560  conserved hypothetical protein  23.12 
 
 
1317 aa  47  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104177  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  23.15 
 
 
1122 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  22.05 
 
 
1010 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24879  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  27.33 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  26.7 
 
 
918 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92797  predicted protein  24.32 
 
 
837 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189677  normal  0.345791 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25292  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.26 
 
 
775 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.025628 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 
1464 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>